Protein–RNA interactions for Protein: P08032

Spta1, Spectrin alpha chain, erythrocytic 1, mousemouse

Predictions only

Length 2,415 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Spta1P08032 Tbc1d12-201ENSMUST00000037302 4209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Maff-201ENSMUST00000096350 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ddost-201ENSMUST00000030538 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Slc25a23-201ENSMUST00000040280 3362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Bag2-203ENSMUST00000187602 378 ntTSL 2 BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.83■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Slc35g1-201ENSMUST00000054098 3471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm38308-201ENSMUST00000194934 1809 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm9885-202ENSMUST00000186234 2209 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 9530068E07Rik-202ENSMUST00000109057 2472 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Fam105a-202ENSMUST00000226145 2950 ntAPPRIS P1 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Rnf181-203ENSMUST00000114095 869 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm16191-201ENSMUST00000141445 520 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 9330154J02Rik-202ENSMUST00000185960 2557 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm20646-202ENSMUST00000199521 660 ntTSL 3 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ptges3-201ENSMUST00000052798 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Nrip1-201ENSMUST00000054178 4529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Arid1a-202ENSMUST00000105897 8175 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tmem132d-201ENSMUST00000044441 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Rrbp1-202ENSMUST00000037875 2701 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tmem254b-201ENSMUST00000022418 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cyba-202ENSMUST00000212600 638 ntTSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 BC049762-201ENSMUST00000054226 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.82■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Wdr41-202ENSMUST00000159647 2289 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Wdr41-206ENSMUST00000167155 2289 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Podxl2-202ENSMUST00000061262 2195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm10418-201ENSMUST00000100943 576 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Speg-202ENSMUST00000113587 1254 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tsen15-205ENSMUST00000162371 431 ntTSL 5 BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm9949-201ENSMUST00000067743 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Klf3-201ENSMUST00000165536 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm9194-201ENSMUST00000220749 1447 ntBASIC15.81■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 0610009B22Rik-202ENSMUST00000109098 892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Edf1-201ENSMUST00000015236 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm27217-201ENSMUST00000183438 882 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ccdc106-201ENSMUST00000045543 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Fbxl5-204ENSMUST00000119523 2801 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Nfs1-202ENSMUST00000109600 709 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tmsb10-202ENSMUST00000114049 690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm15677-201ENSMUST00000152302 766 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Hist1h2bc-201ENSMUST00000018246 1156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Dnph1-201ENSMUST00000046497 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Hist1h2ba-201ENSMUST00000052776 384 ntAPPRIS P1 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Rhbdl1-202ENSMUST00000183929 1349 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Ccnd3-215ENSMUST00000183044 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Creld1-201ENSMUST00000032422 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 March3-201ENSMUST00000035278 860 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Hist2h3b-201ENSMUST00000098843 488 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Inppl1-201ENSMUST00000035836 4995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Pard3-226ENSMUST00000162907 4682 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Nfs1-201ENSMUST00000029147 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 E2f2-201ENSMUST00000061721 4739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Anapc5-205ENSMUST00000197074 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Anapc5-212ENSMUST00000199406 2413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Gm26752-201ENSMUST00000181086 1537 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Tmem254c-202ENSMUST00000100819 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Uso1-201ENSMUST00000031355 3898 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Fbxl7-201ENSMUST00000059204 4632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Spta1P08032 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 46 ms