Protein–RNA interactions for Protein: P06801

Me1, NADP-dependent malic enzyme, mousemouse

Predictions only

Length 572 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Me1P06801 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Shq1-202ENSMUST00000113312 6816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 P2rx2-201ENSMUST00000058016 1895 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Me1P06801 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Wdr90-205ENSMUST00000176923 5666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Me1P06801 Crk-203ENSMUST00000108425 4290 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Me1P06801 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Me1P06801 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Me1P06801 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Me1P06801 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Atp8b1-201ENSMUST00000025482 6440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Tm2d1-201ENSMUST00000030292 952 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Cdh2-201ENSMUST00000025166 4843 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Cadps2-212ENSMUST00000163871 4969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Me1P06801 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Amfr-201ENSMUST00000053766 3880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Timm23-208ENSMUST00000226683 750 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gm10273-201ENSMUST00000092511 1126 ntAPPRIS P1 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Me1P06801 Pkn1-201ENSMUST00000005616 6662 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Lrp3-201ENSMUST00000118444 3877 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Dleu2-210ENSMUST00000183054 722 ntTSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Wdr33-202ENSMUST00000082319 1152 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Snap91-202ENSMUST00000074468 4336 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Ermp1-203ENSMUST00000159692 7058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Tmem198-201ENSMUST00000050899 2456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Syt9-201ENSMUST00000073459 3817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Me1P06801 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gm28374-201ENSMUST00000162374 728 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Tax1bp3-201ENSMUST00000040687 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Stk35-202ENSMUST00000166282 5445 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Me1P06801 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Gm2479-201ENSMUST00000173312 1053 ntTSL 3 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Rex1bd-201ENSMUST00000075175 671 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Rtl8a-201ENSMUST00000088779 1195 ntAPPRIS P1 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Me1P06801 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 32.5 ms