Protein–RNA interactions for Protein: P06321

T-cell receptor beta chain V region A20.2.25, mousemouse

Predictions only

Length 130 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P06321 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Tlcd1-203ENSMUST00000108338 714 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 2310001K24Rik-202ENSMUST00000186760 740 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Cldn24-201ENSMUST00000079639 663 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Gabpa-201ENSMUST00000009120 4987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Bambi-201ENSMUST00000025075 5040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
P06321 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Mark3-202ENSMUST00000084953 3365 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Ndufb2-202ENSMUST00000119379 455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Josd2-206ENSMUST00000121922 684 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 AC112142.1-201ENSMUST00000228796 918 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Cck-201ENSMUST00000035120 691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Gm7712-202ENSMUST00000222331 1510 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Synpo-205ENSMUST00000130044 4970 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Prmt9-202ENSMUST00000118622 2768 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
P06321 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Gm45623-201ENSMUST00000210744 1457 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Il17re-203ENSMUST00000101065 1973 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Syngap1-204ENSMUST00000194598 6011 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 4930412O13Rik-201ENSMUST00000026889 1187 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Prss33-201ENSMUST00000059906 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Sfrp2-201ENSMUST00000029625 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
P06321 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06321 Ank1-209ENSMUST00000121802 8218 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06321 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06321 Rnf146-202ENSMUST00000160144 4323 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06321 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
P06321 Cacna1c-216ENSMUST00000188522 7338 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Anks1-202ENSMUST00000088027 6781 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Auh-202ENSMUST00000110031 3235 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Klf13-201ENSMUST00000063694 6396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Prdm6-201ENSMUST00000091900 2601 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Zmynd19-202ENSMUST00000148042 1103 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 AC175538.1-201ENSMUST00000225343 1269 ntBASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Dus3l-201ENSMUST00000007747 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
P06321 Serac1-201ENSMUST00000024570 2033 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Ergic3-202ENSMUST00000088650 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Gopc-202ENSMUST00000105475 4317 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Npas3-203ENSMUST00000223057 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 5430402O13Rik-201ENSMUST00000126537 869 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Btbd11-203ENSMUST00000105307 5788 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Foxa3-201ENSMUST00000036018 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Pten-201ENSMUST00000013807 8292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Mapk7-203ENSMUST00000108714 3069 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
P06321 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
P06321 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21 ms