Protein–RNA interactions for Protein: P04230

H2-Eb1, H-2 class II histocompatibility antigen, E-B beta chain, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
H2-Eb1P04230 Gng5-201ENSMUST00000090031 593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Camsap2-203ENSMUST00000192314 4916 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Nectin3-202ENSMUST00000023335 9116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Pitx2-201ENSMUST00000029657 1680 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Prps1l3-201ENSMUST00000139049 1720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Itgb4-205ENSMUST00000106461 6208 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Clasrp-201ENSMUST00000086041 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 1810013L24Rik-201ENSMUST00000023150 4066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Ctnnal1-202ENSMUST00000107612 850 ntTSL 3 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Smim10l1-201ENSMUST00000100864 2842 ntAPPRIS P1 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Myo5a-214ENSMUST00000155282 6372 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
H2-Eb1P04230 Dlgap4-212ENSMUST00000169464 4851 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Nhs-201ENSMUST00000081569 4881 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lonrf2-202ENSMUST00000147695 6932 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm45337-201ENSMUST00000210537 1267 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Zfand3-202ENSMUST00000226208 923 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Alcam-201ENSMUST00000023312 6036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Ccdc88a-201ENSMUST00000040182 9376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Cacnb1-204ENSMUST00000107561 1778 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Aldh2-202ENSMUST00000129753 1799 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Mrpl9-201ENSMUST00000029786 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 1110004F10Rik-202ENSMUST00000106607 1153 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm30085-201ENSMUST00000209694 594 ntTSL 3 BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Rasal2-201ENSMUST00000078308 10047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Arhgef10-201ENSMUST00000084207 5528 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Crocc-203ENSMUST00000102491 6582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Rhobtb2-201ENSMUST00000022665 5322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 2810408A11Rik-201ENSMUST00000018714 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Srrm2-209ENSMUST00000190686 8864 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 A830018L16Rik-208ENSMUST00000171690 6158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 1700067K01Rik-201ENSMUST00000060357 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Cdc14b-203ENSMUST00000109770 3052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Eefsec-201ENSMUST00000165242 2679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Car9-201ENSMUST00000030183 2023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Sco2-201ENSMUST00000167643 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Trappc6a-201ENSMUST00000002112 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 AC166341.7-201ENSMUST00000221698 126 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 2900052L18Rik-201ENSMUST00000139014 1588 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
H2-Eb1P04230 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms