Protein–RNA interactions for Protein: P02468

Lamc1, Laminin subunit gamma-1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,607 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lamc1P02468 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Olfr129-201ENSMUST00000122318 993 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Vat1-201ENSMUST00000040430 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Slbp-205ENSMUST00000139518 1191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Rnls-201ENSMUST00000096114 1597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Nnat-202ENSMUST00000109526 1213 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Bex3-204ENSMUST00000178632 933 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Il17b-201ENSMUST00000025471 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Ascl2-201ENSMUST00000009392 1605 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC24.53■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 4930455H04Rik-201ENSMUST00000117592 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Lamc1P02468 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 L3hypdh-201ENSMUST00000019862 1831 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Flg-202ENSMUST00000178008 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Flg-205ENSMUST00000179250 765 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Flg-206ENSMUST00000179477 768 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Gm8909-201ENSMUST00000040467 1357 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Rln3-201ENSMUST00000061923 634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Diras1-201ENSMUST00000055125 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Scml4-203ENSMUST00000105495 1033 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Lamc1P02468 Shisa5-218ENSMUST00000200515 1005 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 52.9 ms