Protein–RNA interactions for Protein: P01869

Ighg1, Ig gamma-1 chain C region, membrane-bound form, mousemouse

Predictions only

Length 393 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ighg1P01869 Snph-203ENSMUST00000109875 4910 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Mtmr12-201ENSMUST00000038172 6840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Actr3-201ENSMUST00000027579 2554 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Cdca3-201ENSMUST00000024270 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Kank3-201ENSMUST00000048560 2641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Nfib-204ENSMUST00000107246 3075 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Msx2-201ENSMUST00000021922 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Klc3-202ENSMUST00000108457 1632 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Josd2-203ENSMUST00000118493 922 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Gm29241-201ENSMUST00000189260 1096 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 4930505A04Rik-201ENSMUST00000041763 904 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Fbxo33-201ENSMUST00000043204 3688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Lrrc43-202ENSMUST00000121444 2016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Nfe2l1-202ENSMUST00000107657 3869 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Gm37820-201ENSMUST00000194021 2147 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Ngb-201ENSMUST00000021420 1616 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 2810405F15Rik-201ENSMUST00000195368 932 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Trip10-205ENSMUST00000224885 2136 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Impdh1-210ENSMUST00000162739 2471 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Lrp6-201ENSMUST00000032322 9368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Dlx3-201ENSMUST00000092768 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Wt1-205ENSMUST00000143043 3090 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Mob2-201ENSMUST00000084418 1490 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 C130073E24Rik-201ENSMUST00000210222 6144 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Rmdn3-201ENSMUST00000094695 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Tpsb2-201ENSMUST00000069616 1081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Nrxn1-206ENSMUST00000160800 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Klf14-201ENSMUST00000101589 3056 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Xpo6-213ENSMUST00000168189 4552 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Sntg2-201ENSMUST00000021004 2411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Knl1-201ENSMUST00000028799 5527 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Ighg1P01869 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Snx12-204ENSMUST00000156473 1114 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gm2990-201ENSMUST00000180662 1118 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Mir6349-201ENSMUST00000184059 97 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Fzd5-201ENSMUST00000063982 6915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Tsc22d2-203ENSMUST00000199164 4659 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Otud5-202ENSMUST00000115665 3821 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Wipi2-201ENSMUST00000036872 5171 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Mfsd13a-202ENSMUST00000128041 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Zic5-201ENSMUST00000039118 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gm13401-201ENSMUST00000117074 291 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gm13158-201ENSMUST00000122007 736 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 1700007L15Rik-201ENSMUST00000180923 737 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Sptbn4-202ENSMUST00000108362 4861 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Ruvbl1-201ENSMUST00000032165 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Rfx7-202ENSMUST00000163401 7880 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Aida-206ENSMUST00000193625 1810 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Ighg1P01869 Abtb1-201ENSMUST00000032169 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.1 ms