Protein–RNA interactions for Protein: P01808

Ig heavy chain V region T601, mousemouse

Predictions only

Length 119 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01808 Letm1-201ENSMUST00000005431 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
P01808 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Gm3264-202ENSMUST00000166776 882 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Gm20472-201ENSMUST00000174403 1240 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Anapc13-203ENSMUST00000188398 727 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Lce1m-201ENSMUST00000029520 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Fxn-201ENSMUST00000081333 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Gzmd-201ENSMUST00000082093 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Eif2b4-201ENSMUST00000077693 2025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Rassf7-201ENSMUST00000046890 1525 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
P01808 Tmem127-201ENSMUST00000035871 4811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Whrn-205ENSMUST00000095038 2665 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Rassf8-203ENSMUST00000111704 5446 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Fgf8-202ENSMUST00000026241 1168 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Odf1-201ENSMUST00000081966 1105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Neurl1b-201ENSMUST00000053020 6195 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Fst-201ENSMUST00000022287 2556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01808 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Epn1-202ENSMUST00000098845 2565 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Cpeb2-204ENSMUST00000166713 6846 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Arhgap21-201ENSMUST00000114594 7351 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Slc25a41-202ENSMUST00000169012 1172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Pfdn4-201ENSMUST00000063682 935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Zc3hav1l-201ENSMUST00000058524 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 March8-202ENSMUST00000101032 4611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01808 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Sri-205ENSMUST00000148633 2251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Mfhas1-201ENSMUST00000037666 6408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 C1qtnf5-202ENSMUST00000114816 1259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 2210408F21Rik-211ENSMUST00000151800 750 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Atad2b-201ENSMUST00000045664 8035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Mbp-201ENSMUST00000047865 2492 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01808 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01808 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01808 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01808 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.9 ms