Protein–RNA interactions for Protein: P01735

T-cell receptor beta chain V region 86T1, mousemouse

Predictions only

Length 133 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01735 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
P01735 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Acot8-202ENSMUST00000103094 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Atp5g1-203ENSMUST00000107686 691 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Unc50-203ENSMUST00000118059 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Acot8-201ENSMUST00000017451 1055 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 D130020L05Rik-202ENSMUST00000220889 769 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Map3k7-202ENSMUST00000080933 5669 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Sult2b1-204ENSMUST00000209739 1858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
P01735 Dnajc19-201ENSMUST00000011029 2499 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Cpox-201ENSMUST00000060077 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Pcnx-204ENSMUST00000221721 8318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Cerkl-205ENSMUST00000143974 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
P01735 Zfand5-201ENSMUST00000025659 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Hist1h2bh-201ENSMUST00000224359 1679 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Ccdc107-202ENSMUST00000107922 865 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
P01735 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Samd8-201ENSMUST00000022292 1574 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Uhrf2-201ENSMUST00000025739 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Scrib-201ENSMUST00000002603 5599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Dnlz-201ENSMUST00000028295 2916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Pitpnm2-210ENSMUST00000162812 6952 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Fam109a-203ENSMUST00000198271 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Slit3-201ENSMUST00000069837 5228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Eps8-201ENSMUST00000058210 4567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
P01735 Kctd9-205ENSMUST00000152243 2528 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Uhmk1-202ENSMUST00000123399 7775 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Myrip-201ENSMUST00000048121 4906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Gm13816-201ENSMUST00000152230 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Itsn1-205ENSMUST00000113996 5147 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
P01735 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 A930001A20Rik-201ENSMUST00000182586 1366 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Zfp746-201ENSMUST00000073124 3651 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
P01735 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.4 ms