Protein–RNA interactions for Protein: P01680

Ig kappa chain V-IV region S107B, mousemouse

Predictions only

Length 129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01680 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01680 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01680 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01680 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.33■□□□□ 0.04
P01680 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC15.33■□□□□ 0.04
P01680 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Fbxo45-201ENSMUST00000042732 4179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.32■□□□□ 0.04
P01680 A630072M18Rik-201ENSMUST00000190567 5410 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Htr6-202ENSMUST00000105802 2341 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Pafah1b3-201ENSMUST00000005583 901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Kcnt1-203ENSMUST00000114172 5219 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.31■□□□□ 0.04
P01680 Pde7a-202ENSMUST00000099195 6298 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Akt2-205ENSMUST00000108344 4544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Tle4-202ENSMUST00000167776 4545 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.3■□□□□ 0.04
P01680 Lrig1-202ENSMUST00000101126 4951 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 A930012L18Rik-201ENSMUST00000181094 2364 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Mbd6-202ENSMUST00000119078 4287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Kcng3-201ENSMUST00000051482 3356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 A730056A06Rik-201ENSMUST00000181299 2689 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.29■□□□□ 0.04
P01680 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.29■□□□□ 0.04
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28.8 ms