Protein–RNA interactions for Protein: P01672

Ig kappa chain V-III region PC 7940, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01672 Ccnd2-202ENSMUST00000201066 983 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Mark3-201ENSMUST00000075281 3321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Nkpd1-201ENSMUST00000078908 2753 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
P01672 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Agpat3-202ENSMUST00000105387 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Ern1-203ENSMUST00000106800 654 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Ptpdc1-204ENSMUST00000222028 3164 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC17.03■□□□□ 0.32
P01672 Gaa-202ENSMUST00000106258 1369 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Prss53-202ENSMUST00000205300 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Nkx2-2-203ENSMUST00000109970 1053 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Atf7ip2-204ENSMUST00000119023 1048 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 9130019P16Rik-203ENSMUST00000185712 650 ntTSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 1700020N01Rik-201ENSMUST00000057341 1062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Magi2-202ENSMUST00000101558 6530 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
P01672 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.02■□□□□ 0.31
P01672 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Tmem47-203ENSMUST00000171953 1801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Ccnd2-204ENSMUST00000201637 1006 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 2310033P09Rik-201ENSMUST00000020719 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Gm45148-201ENSMUST00000208578 513 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Arhgef4-208ENSMUST00000211073 171 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Mfap2-201ENSMUST00000071977 1073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Gm10812-201ENSMUST00000099864 546 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
P01672 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Dclk2-208ENSMUST00000194452 2066 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Otx2-204ENSMUST00000122009 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Zfp629-207ENSMUST00000134446 670 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 B430219N15Rik-201ENSMUST00000147230 835 ntTSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Nnat-205ENSMUST00000153739 1146 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Nnat-206ENSMUST00000172487 404 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Smim15-206ENSMUST00000226042 1092 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
P01672 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01672 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01672 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01672 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
P01672 Gm14968-201ENSMUST00000155528 769 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.4 ms