Protein–RNA interactions for Protein: P01667

Ig kappa chain V-III region PC 6308, mousemouse

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Length 111 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01667 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01667 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01667 Pnck-202ENSMUST00000114472 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01667 Psen2-205ENSMUST00000111108 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01667 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01667 Sco1-201ENSMUST00000092996 2412 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01667 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Tmem8-201ENSMUST00000025010 3464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Hand1-201ENSMUST00000036917 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Nmnat3-201ENSMUST00000112935 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Tpm1-208ENSMUST00000113689 904 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Gm3375-201ENSMUST00000203929 796 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Rps12-206ENSMUST00000218221 460 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Gm10549-201ENSMUST00000097634 450 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Tmem163-203ENSMUST00000160616 2657 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Stim2-204ENSMUST00000201469 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 B4galt5-201ENSMUST00000109221 4210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01667 Wnk2-210ENSMUST00000162403 6147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Vmn1r17-201ENSMUST00000227186 2234 ntAPPRIS P2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Timm44-201ENSMUST00000003029 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Dohh-206ENSMUST00000131968 672 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Gm17035-201ENSMUST00000170557 419 ntTSL 3 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Spcs1-201ENSMUST00000186131 1005 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Zfas1-205ENSMUST00000189909 738 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Gm45894-202ENSMUST00000212728 1097 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 AC156016.1-201ENSMUST00000227190 1035 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Aprt-201ENSMUST00000006764 849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Sox12-201ENSMUST00000063332 4169 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
P01667 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Gm45774-201ENSMUST00000211992 2665 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Gm13647-201ENSMUST00000154654 622 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Rps2-ps2-201ENSMUST00000194305 881 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Fgf22-203ENSMUST00000219981 1070 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 AC124601.2-201ENSMUST00000222888 759 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Cbarp-201ENSMUST00000105369 3121 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Kmt5b-202ENSMUST00000052699 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Ripor2-202ENSMUST00000058009 2550 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Pacsin3-202ENSMUST00000059566 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
P01667 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Clta-203ENSMUST00000107847 1121 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Gm22240-201ENSMUST00000175225 82 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Kcmf1-206ENSMUST00000206378 544 ntTSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Otx2os1-204ENSMUST00000227221 751 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
P01667 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Rgs19-207ENSMUST00000108779 642 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Krt88-201ENSMUST00000023781 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Lat-201ENSMUST00000032997 1235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.88■□□□□ 0.13
P01667 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 49.5 ms