Protein–RNA interactions for Protein: P01665

Ig kappa chain V-III region PC 7043, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01665 Rragd-203ENSMUST00000098190 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Hmgxb3-201ENSMUST00000091884 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Gusb-202ENSMUST00000111307 932 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Zfp467-208ENSMUST00000114564 626 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Rint1-204ENSMUST00000117783 560 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Guca1a-201ENSMUST00000059348 871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Brd3os-202ENSMUST00000209765 1898 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Rusc1-203ENSMUST00000166687 1922 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01665 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Gm12085-201ENSMUST00000119263 940 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Gm13168-201ENSMUST00000121771 632 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Phgr1-202ENSMUST00000130293 542 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Utf1-201ENSMUST00000168457 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Gm16042-201ENSMUST00000204813 1247 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 AC153881.1-201ENSMUST00000214448 284 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Ccser1-203ENSMUST00000126214 5657 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Lin9-203ENSMUST00000192561 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Esrrb-201ENSMUST00000021680 2136 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01665 Mdm1-204ENSMUST00000169817 2022 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Naxd-201ENSMUST00000033901 1359 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Epo-203ENSMUST00000111039 706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Echdc2-204ENSMUST00000116309 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Impa1-204ENSMUST00000191670 1100 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Erlin1-201ENSMUST00000071698 3228 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Cdv3-201ENSMUST00000035484 3387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Ttc34-203ENSMUST00000207854 4733 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Mst1-204ENSMUST00000162886 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Rbck1-202ENSMUST00000109847 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01665 Lrrfip2-202ENSMUST00000098340 3191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Antxr2-202ENSMUST00000199088 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Xpr1-202ENSMUST00000111774 2753 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Sp3os-201ENSMUST00000123087 583 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Cox7a2l-202ENSMUST00000167741 1147 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Casp3-203ENSMUST00000210534 583 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Map7-205ENSMUST00000214231 675 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Ggnbp2-201ENSMUST00000018547 2478 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Lrrc36-206ENSMUST00000216765 2301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Cbx2-201ENSMUST00000026662 3807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
P01665 Irak1-205ENSMUST00000114353 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01665 Zfp648-201ENSMUST00000086195 1892 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.22
P01665 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Ccdc166-202ENSMUST00000183130 1563 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Large2-215ENSMUST00000176810 2477 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Hoxb2-201ENSMUST00000100523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Gm13181-201ENSMUST00000120117 1069 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Gm17098-201ENSMUST00000166507 628 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 AC154649.1-201ENSMUST00000227392 384 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Cadm1-201ENSMUST00000034581 1254 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Pusl1-201ENSMUST00000097737 1243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Cxcl12-202ENSMUST00000112866 1878 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Fam20c-201ENSMUST00000026972 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Cap1-202ENSMUST00000106255 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
P01665 Fhl2-201ENSMUST00000008280 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
P01665 Arhgef9-216ENSMUST00000197206 2227 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms