Protein–RNA interactions for Protein: P01664

Ig kappa chain V-III region CBPC 101, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01664 Cpsf4-207ENSMUST00000162244 1387 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01664 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01664 Mipep-201ENSMUST00000063562 3015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01664 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01664 Znrf1-201ENSMUST00000095176 3108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01664 Osbpl1a-205ENSMUST00000119512 1947 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01664 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
P01664 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 4930448E22Rik-202ENSMUST00000215242 2102 ntTSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Stxbp3-205ENSMUST00000138552 1789 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Zkscan2-203ENSMUST00000128217 2218 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Slain2-202ENSMUST00000144843 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Atg5-201ENSMUST00000039286 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Plekhh3-206ENSMUST00000164474 3010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01664 Eif1-201ENSMUST00000049385 1322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Smarca4-201ENSMUST00000034707 6354 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Cxadr-201ENSMUST00000023572 5734 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Gls-204ENSMUST00000114513 4966 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Plekhh3-201ENSMUST00000043397 3056 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Hap1-201ENSMUST00000103124 2120 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Gpc3-201ENSMUST00000069360 2216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Srcin1-201ENSMUST00000107590 5493 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Gm16764-202ENSMUST00000148931 433 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 AC107711.5-202ENSMUST00000226429 702 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Carmn-201ENSMUST00000181155 1778 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Mycs-201ENSMUST00000058404 2368 ntAPPRIS P1 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Sh2b1-203ENSMUST00000205440 3089 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Cnot9-201ENSMUST00000087215 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Nphp3-201ENSMUST00000035167 5899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Sufu-202ENSMUST00000111867 1747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01664 Fcho1-209ENSMUST00000146100 3188 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Whrn-206ENSMUST00000102867 4013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Gm5643-201ENSMUST00000117081 966 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Stmn4-202ENSMUST00000118426 1281 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Gm37025-201ENSMUST00000195159 829 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Ick-201ENSMUST00000009972 873 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Fhl1-203ENSMUST00000114769 2770 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Rab27b-202ENSMUST00000117692 2842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Acsl3-205ENSMUST00000142704 2976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Gart-202ENSMUST00000120450 1865 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01664 Stk33-201ENSMUST00000090414 2221 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Osbpl1a-208ENSMUST00000121888 2674 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Dok4-201ENSMUST00000046461 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 E230025N22Rik-201ENSMUST00000115682 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Mon1a-201ENSMUST00000035202 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Uts2r-201ENSMUST00000039044 1703 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Atp6v0a2-201ENSMUST00000037865 5345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Gm20544-201ENSMUST00000174338 690 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Hyls1-201ENSMUST00000115110 1973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Krt84-201ENSMUST00000023720 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Gpr150-201ENSMUST00000056130 2146 ntAPPRIS P1 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Fbxl19-204ENSMUST00000188580 2601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01664 Fam46a-202ENSMUST00000187711 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 4921536K21Rik-201ENSMUST00000020712 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Gpr137b-201ENSMUST00000021738 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Cdv3-207ENSMUST00000190226 3107 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Nox4-202ENSMUST00000068829 1861 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Adam22-201ENSMUST00000046838 2773 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Slc6a8-204ENSMUST00000114467 2509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Evx2-201ENSMUST00000001867 4191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Tpgs1-201ENSMUST00000020552 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Gm46218-201ENSMUST00000215448 801 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Tead3-201ENSMUST00000114799 2448 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Capg-202ENSMUST00000114071 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Ankra2-204ENSMUST00000150352 2217 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Dyx1c1-201ENSMUST00000034734 1975 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01664 Wnt1-201ENSMUST00000023734 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 45 ms