Protein–RNA interactions for Protein: P01662

Ig kappa chain V-III region ABPC 22/PC 9245, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01662 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01662 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01662 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01662 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 Dscam-201ENSMUST00000056102 7498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01662 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01662 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01662 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01662 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01662 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01662 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms