Protein–RNA interactions for Protein: P01661

Ig kappa chain V-III region MOPC 63, mousemouse

Predictions only

Length 131 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01661 Gm20049-201ENSMUST00000219950 730 ntBASIC15.21■□□□□ 0.03
P01661 Tmem270-201ENSMUST00000047305 932 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01661 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01661 Slc29a1-202ENSMUST00000064889 1988 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01661 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.03
P01661 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01661 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01661 Klhl5-204ENSMUST00000204097 3149 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01661 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01661 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01661 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01661 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.21■□□□□ 0.02
P01661 Rev1-201ENSMUST00000027251 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Zic3-202ENSMUST00000088629 1951 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 B4galnt4-201ENSMUST00000048002 3556 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Gtf2a2-204ENSMUST00000119905 622 ntTSL 2 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Tmem54-201ENSMUST00000030575 1064 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Rcbtb2-226ENSMUST00000171767 2692 ntTSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Zfp282-201ENSMUST00000061890 5573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Gm8839-201ENSMUST00000121279 1645 ntBASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Atg4c-201ENSMUST00000030279 3178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.2■□□□□ 0.02
P01661 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Prrt4-201ENSMUST00000159200 3411 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 A930003O13Rik-203ENSMUST00000199056 1955 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Cmtm7-204ENSMUST00000216760 665 ntTSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Rpl38-202ENSMUST00000082092 345 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Ccnl1-201ENSMUST00000029416 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Tle4-201ENSMUST00000052011 4555 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Enoph1-202ENSMUST00000169390 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC15.19■□□□□ 0.02
P01661 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 H2-Eb1-201ENSMUST00000074557 1184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Rock2-201ENSMUST00000020904 7644 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Sar1a-201ENSMUST00000020285 2613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Pole4-201ENSMUST00000095786 1769 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Lrch3-203ENSMUST00000135193 2794 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Adam33-201ENSMUST00000052104 2795 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
P01661 Tssk6-201ENSMUST00000050373 1335 ntAPPRIS P1 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Pcdhac2-201ENSMUST00000047479 5888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Aipl1-201ENSMUST00000048207 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Lzts2-203ENSMUST00000179108 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Tox2-205ENSMUST00000165937 1675 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Slain2-201ENSMUST00000143829 4828 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Tfam-203ENSMUST00000121685 899 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Gm12441-201ENSMUST00000121806 588 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Nrxn2-202ENSMUST00000113458 3503 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Dnaaf3-201ENSMUST00000094897 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Tnfrsf13c-201ENSMUST00000089161 1906 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Nek9-201ENSMUST00000040992 5386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
P01661 Rybp-201ENSMUST00000101118 4503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Rbm12b1-202ENSMUST00000069128 3069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Tmprss5-201ENSMUST00000070390 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 1600023N17Rik-201ENSMUST00000196242 1007 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
P01661 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30 ms