Protein–RNA interactions for Protein: P01657

Ig kappa chain V-III region PC 2413, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01657 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Med16-204ENSMUST00000165684 2950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
P01657 3110043O21Rik-203ENSMUST00000108127 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Kxd1-202ENSMUST00000117580 696 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Arfip1-202ENSMUST00000107687 1714 ntTSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Gramd1a-201ENSMUST00000001280 2713 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Azi2-207ENSMUST00000134433 2499 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
P01657 Nr1h2-213ENSMUST00000167197 1944 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Syndig1-202ENSMUST00000109935 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Psme3-201ENSMUST00000019470 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Ankrd39-201ENSMUST00000001172 2109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Bex1-203ENSMUST00000113120 718 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Zfp133-ps-202ENSMUST00000124788 1079 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Gm13524-201ENSMUST00000125869 662 ntTSL 3 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Gm12536-201ENSMUST00000129102 358 ntTSL 2 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Rhox13-201ENSMUST00000152730 876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Cyb5r4-201ENSMUST00000168529 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 H2-T-ps-201ENSMUST00000172538 1067 ntBASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Pds5a-209ENSMUST00000201948 8934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Akain1-201ENSMUST00000169935 2296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.15■□□□□ 0.18
P01657 Txnl4b-201ENSMUST00000034159 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Unc5b-201ENSMUST00000077925 5869 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Prm2-201ENSMUST00000037996 621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Pxk-202ENSMUST00000112689 2840 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Gm42900-201ENSMUST00000197184 2167 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Iqcd-202ENSMUST00000094391 1673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.14■□□□□ 0.17
P01657 Galnt9-201ENSMUST00000040001 2883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Ism1-201ENSMUST00000099307 2944 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Sh3glb1-205ENSMUST00000199854 1416 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 2210408F21Rik-212ENSMUST00000152157 490 ntTSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Apopt1-204ENSMUST00000163220 671 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Hikeshi-207ENSMUST00000207309 835 ntTSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Arhgap33-206ENSMUST00000208522 781 ntTSL 3 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Smad7-201ENSMUST00000026999 4278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Ubl7-201ENSMUST00000163329 1364 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Ube2f-204ENSMUST00000178627 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Gnptg-202ENSMUST00000115154 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.13■□□□□ 0.17
P01657 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Gm26892-201ENSMUST00000181695 1636 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Rfesd-203ENSMUST00000179078 1436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 A730060N03Rik-201ENSMUST00000174277 2124 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Gm28577-201ENSMUST00000176106 741 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 4930458A03Rik-201ENSMUST00000198197 961 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Cklf-201ENSMUST00000034342 667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Olfr571-201ENSMUST00000061738 969 ntAPPRIS P1 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Thoc7-201ENSMUST00000065865 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Rcc1-201ENSMUST00000030726 2278 ntTSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Prcc-201ENSMUST00000005015 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Fam3c-205ENSMUST00000165576 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Tbkbp1-203ENSMUST00000107614 2391 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.12■□□□□ 0.17
P01657 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01657 Stx2-201ENSMUST00000031378 2939 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
P01657 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.6 ms