Protein–RNA interactions for Protein: P01656

Ig kappa chain V-III region MOPC 70, mousemouse

Predictions only

Length 111 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01656 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
P01656 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01656 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
P01656 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Slc43a1-202ENSMUST00000111624 2556 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Sox18-201ENSMUST00000054491 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Rapgef1-203ENSMUST00000102872 6402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Runx2-204ENSMUST00000159943 2316 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 H2-Q6-201ENSMUST00000113879 981 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Gm17092-201ENSMUST00000166606 698 ntTSL 2 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Gm27741-201ENSMUST00000185060 237 ntBASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Cryl1-201ENSMUST00000022517 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Rnf112-201ENSMUST00000054927 3086 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Dhx32-203ENSMUST00000106139 2233 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
P01656 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 A730089K16Rik-201ENSMUST00000194526 2427 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Gm11336-201ENSMUST00000118168 334 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Vps53-202ENSMUST00000094015 2645 ntTSL 5 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC16.44■□□□□ 0.22
P01656 Taf4b-201ENSMUST00000169862 5149 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Acvrl1-203ENSMUST00000119063 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Fmnl2-201ENSMUST00000049483 5461 ntTSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Ahcyl2-204ENSMUST00000115242 5152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Gm16295-201ENSMUST00000139512 643 ntTSL 3 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Cd70-201ENSMUST00000019633 842 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Gm19935-201ENSMUST00000209208 979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Gzme-201ENSMUST00000089549 916 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Sox30-201ENSMUST00000049038 2997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Ppp2r1b-206ENSMUST00000175645 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
P01656 Uchl5-201ENSMUST00000018333 1845 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 4932702P03Rik-201ENSMUST00000138447 1482 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Mag-207ENSMUST00000191081 2007 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Cldn6-201ENSMUST00000024699 1506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Gdf15-201ENSMUST00000003808 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Gm16075-201ENSMUST00000135873 361 ntTSL 3 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Zfp219-204ENSMUST00000226522 2804 ntAPPRIS P2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Tenm3-204ENSMUST00000110346 2267 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
P01656 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Cacul1-203ENSMUST00000166712 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 F420014N23Rik-202ENSMUST00000219079 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Gm18115-201ENSMUST00000221209 621 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Thrsp-201ENSMUST00000043077 1277 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
P01656 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.7 ms