Protein–RNA interactions for Protein: P01652

Ig kappa chain V-V region J606, mousemouse

Predictions only

Length 108 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01652 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Scaf11-201ENSMUST00000047835 5766 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Gm15138-201ENSMUST00000151778 379 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Fbxo9-203ENSMUST00000159099 1201 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Dusp13-213ENSMUST00000184703 902 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 D230030E09Rik-201ENSMUST00000222459 884 ntTSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Cdkl3-207ENSMUST00000109080 2749 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Anapc5-218ENSMUST00000200645 2404 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Gxylt1-201ENSMUST00000049484 6611 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Ankrd17-214ENSMUST00000218526 4938 ntTSL 5 BASIC17.79■□□□□ 0.44
P01652 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Cyth2-201ENSMUST00000056820 2527 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Atp9a-203ENSMUST00000109176 3691 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Surf4-201ENSMUST00000015011 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Fam131a-202ENSMUST00000118919 2262 ntTSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Nkiras2-201ENSMUST00000017981 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Gm37519-201ENSMUST00000191687 2210 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Usp13-202ENSMUST00000108228 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Eif3h-201ENSMUST00000022925 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Arhgap23-203ENSMUST00000121799 5816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Lrrc75b-201ENSMUST00000051129 4601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Chpt1-203ENSMUST00000117440 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Gm29514-202ENSMUST00000186665 2214 ntTSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.78■□□□□ 0.44
P01652 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Nxt1-202ENSMUST00000109961 1116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Tmem60-201ENSMUST00000115259 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Gm6728-201ENSMUST00000178117 1065 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Nxt1-201ENSMUST00000047177 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Fam117b-201ENSMUST00000036540 5532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
P01652 Hnrnpd-211ENSMUST00000172361 6811 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01652 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.77■□□□□ 0.43
P01652 Nrros-203ENSMUST00000115165 2389 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Lyzl4-202ENSMUST00000120918 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Gm13420-201ENSMUST00000129574 1091 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Rpl21-202ENSMUST00000075453 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Ankle2-202ENSMUST00000086674 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Fam104a-201ENSMUST00000120194 2619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.76■□□□□ 0.43
P01652 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Ppp1r3f-201ENSMUST00000115742 3066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Ddx59-201ENSMUST00000027655 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Mafg-202ENSMUST00000106180 732 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Mafg-204ENSMUST00000106182 1104 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Asnsd1-202ENSMUST00000123519 983 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Nkx2-9-201ENSMUST00000072631 1264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.75■□□□□ 0.43
P01652 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22 ms