Protein–RNA interactions for Protein: P01638

Ig kappa chain V-V region L6 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01638 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
P01638 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Ankle2-201ENSMUST00000031474 5215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Atp5g1-202ENSMUST00000107684 596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 9430097D07Rik-201ENSMUST00000100190 1501 ntAPPRIS P1 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Msl1-204ENSMUST00000107487 2836 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
P01638 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Igf2bp2-201ENSMUST00000100052 3899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Osbpl1a-203ENSMUST00000118313 2893 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Lamtor5-202ENSMUST00000199317 743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 A430033K04Rik-204ENSMUST00000200521 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 A430033K04Rik-201ENSMUST00000032590 1109 ntTSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Igfbp2-201ENSMUST00000047328 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Ubtf-204ENSMUST00000107117 3258 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 5031439G07Rik-201ENSMUST00000047144 6845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
P01638 Vav2-201ENSMUST00000056176 5221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Ssx2ip-204ENSMUST00000106153 3446 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Cog2-201ENSMUST00000034460 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Zfp689-202ENSMUST00000106299 1417 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Gm9774-202ENSMUST00000192538 1392 ntAPPRIS P1 BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Gm27389-201ENSMUST00000183622 195 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Ttc19-201ENSMUST00000050646 3410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
P01638 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Casp6-201ENSMUST00000029626 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Bpnt1-202ENSMUST00000110965 1046 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Gm23634-201ENSMUST00000175071 91 ntBASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Cnn1-203ENSMUST00000214601 1225 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Krtcap3-201ENSMUST00000054829 904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Lrrc14-204ENSMUST00000137649 2832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Gm16863-201ENSMUST00000181476 2431 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Plekhh1-201ENSMUST00000039928 6439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Gab1-202ENSMUST00000210676 4985 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Acot1-201ENSMUST00000168120 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
P01638 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Eif1b-201ENSMUST00000007139 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
P01638 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 48.3 ms