Protein–RNA interactions for Protein: P01637

Ig kappa chain V-V region T1, mousemouse

Predictions only

Length 128 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01637 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Ogg1-201ENSMUST00000032406 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.07■□□□□ 0.16
P01637 Plekhg3-207ENSMUST00000219063 4535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Gm38282-201ENSMUST00000192751 695 ntTSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Gm5587-201ENSMUST00000206270 674 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Kiss1r-202ENSMUST00000219745 979 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 AC130671.1-201ENSMUST00000227384 1237 ntBASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Prss27-201ENSMUST00000059482 1253 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Nrxn2-203ENSMUST00000113459 3285 ntTSL 2 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Ebf3-201ENSMUST00000033378 4838 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Bub3-201ENSMUST00000084502 2218 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Atp9a-211ENSMUST00000178504 3668 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC16.06■□□□□ 0.16
P01637 Insm1-201ENSMUST00000089257 3100 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Ngrn-201ENSMUST00000117989 1317 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.05■□□□□ 0.16
P01637 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Asnsd1-201ENSMUST00000027264 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Gm8797-201ENSMUST00000192045 490 ntAPPRIS P1 BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Hint1-201ENSMUST00000020504 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Fuz-201ENSMUST00000071207 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Map1lc3b-204ENSMUST00000181826 2633 ntBASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.04■□□□□ 0.16
P01637 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Gm8258-201ENSMUST00000055593 1449 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Cldn4-201ENSMUST00000051401 1816 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Baz1a-201ENSMUST00000038926 6188 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 St7l-201ENSMUST00000059271 5728 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Ddx19a-201ENSMUST00000040416 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Kcnj4-201ENSMUST00000057801 2148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Zfyve9-202ENSMUST00000106657 6459 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Lrp5-202ENSMUST00000176867 2759 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Gm15545-203ENSMUST00000150613 1059 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Gfod2-203ENSMUST00000155038 951 ntTSL 2 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Utp23-204ENSMUST00000161651 582 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Itsn2-201ENSMUST00000062580 5987 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Tnfrsf25-202ENSMUST00000035275 1603 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Nsg1-201ENSMUST00000031009 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Psmd8-203ENSMUST00000186182 1512 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Hhipl1-201ENSMUST00000021685 5174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Apba3-201ENSMUST00000057798 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.03■□□□□ 0.16
P01637 Doc2g-201ENSMUST00000025806 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.02■□□□□ 0.16
P01637 Taf6l-211ENSMUST00000177056 2006 ntTSL 5 BASIC16.02■□□□□ 0.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 26.2 ms