Protein–RNA interactions for Protein: P01635

Ig kappa chain V-V region K2 (Fragment), mousemouse

Predictions only

Length 115 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
P01635 Asap2-202ENSMUST00000064595 5678 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Npm3-ps1-201ENSMUST00000119728 528 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Cetn4-205ENSMUST00000140956 2981 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Gm2431-201ENSMUST00000171531 519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Mir6982-201ENSMUST00000184354 68 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Npm3-201ENSMUST00000070215 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Osgin2-201ENSMUST00000037198 2658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
P01635 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01635 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
P01635 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Sorcs2-201ENSMUST00000037370 5707 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Exoc3l2-202ENSMUST00000137613 4016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Slc26a10-205ENSMUST00000222911 3067 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Bad-202ENSMUST00000113423 990 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Rpl18-ps2-201ENSMUST00000118863 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Gm11539-201ENSMUST00000119837 557 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Gm13436-201ENSMUST00000120418 567 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Gm42884-202ENSMUST00000202523 423 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Nnat-201ENSMUST00000088484 458 ntTSL 2 BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Mapkapk3-201ENSMUST00000035194 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 4732440D04Rik-203ENSMUST00000191825 5428 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
P01635 Ppp2r1b-204ENSMUST00000174628 2195 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Praf2-201ENSMUST00000033489 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Sort1-203ENSMUST00000135636 6836 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Ing4-205ENSMUST00000140131 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Hps4-201ENSMUST00000035279 2836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Gm15565-201ENSMUST00000118890 427 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Calu-208ENSMUST00000173694 611 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Dpep3-201ENSMUST00000034371 1698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Gm15635-204ENSMUST00000208024 2539 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Senp3-202ENSMUST00000066760 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
P01635 Asb1-202ENSMUST00000086843 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Ccdc126-201ENSMUST00000055559 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Ecel1-204ENSMUST00000161002 3033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Gm10830-201ENSMUST00000186379 636 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Dcaf12l2-201ENSMUST00000115057 2885 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Vsig10l-204ENSMUST00000203769 2473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Nrxn1-217ENSMUST00000174337 3021 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 St3gal2-201ENSMUST00000034197 4396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Rbbp7-203ENSMUST00000112327 1862 ntTSL 5 BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
P01635 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Caskin1-201ENSMUST00000024958 6172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Rnf44-204ENSMUST00000125871 4292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Eda-204ENSMUST00000113777 1056 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Gm12979-201ENSMUST00000145488 405 ntTSL 2 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Pih1d2-201ENSMUST00000000171 1256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Eloc-203ENSMUST00000185771 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC15.92■□□□□ 0.14
P01635 Gm45709-201ENSMUST00000213052 1075 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.6 ms