Protein–RNA interactions for Protein: P01575

Ifnb1, Interferon beta, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ifnb1P01575 Hnrnph1-201ENSMUST00000069304 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Mapk8ip3-221ENSMUST00000178969 5579 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 4930447C04Rik-202ENSMUST00000110489 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Sncb-201ENSMUST00000036825 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Kif7-202ENSMUST00000178048 4524 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Hist1h4c-201ENSMUST00000102967 820 ntAPPRIS P1 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Tmem233-201ENSMUST00000111997 2477 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Tmem132e-201ENSMUST00000054245 4386 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gm17055-201ENSMUST00000166951 2232 ntTSL 5 BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Tnfsf14-201ENSMUST00000005976 1859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.18■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Tbc1d9b-202ENSMUST00000101270 5213 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gm10653-202ENSMUST00000139570 835 ntBASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Stmn1-201ENSMUST00000030636 1060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Edem1-201ENSMUST00000089162 5817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Lbp-202ENSMUST00000109491 1322 ntTSL 2 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Vgf-201ENSMUST00000041543 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Matk-202ENSMUST00000117488 1980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Nr1h2-201ENSMUST00000073488 1999 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Ctla2a-201ENSMUST00000021880 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Cacna1b-202ENSMUST00000070864 9655 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.17■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Prkar2a-201ENSMUST00000035220 4965 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Prss16-204ENSMUST00000150547 1159 ntTSL 3 BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Cck-204ENSMUST00000216138 799 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.16■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Rpf1-203ENSMUST00000199079 1978 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Eml2-203ENSMUST00000120595 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Romo1-202ENSMUST00000109597 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gm15378-201ENSMUST00000121894 207 ntBASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Zfp560-202ENSMUST00000143992 608 ntTSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Gm44899-201ENSMUST00000207451 391 ntTSL 3 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Tnnt2-201ENSMUST00000027671 1064 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Lonp1-201ENSMUST00000047226 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Siglecf-202ENSMUST00000121494 1572 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Cds2-202ENSMUST00000103181 8396 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.15■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Mon2-202ENSMUST00000073792 9301 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.5
Ifnb1P01575 Mapk1-202ENSMUST00000069107 5099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 CT010444.2-201ENSMUST00000217877 1629 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 2900072N19Rik-201ENSMUST00000123840 806 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Serf1-204ENSMUST00000151821 570 ntTSL 2 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 E030044B06Rik-201ENSMUST00000181195 1266 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm7292-201ENSMUST00000194706 2527 ntBASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.14■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Hspa8-201ENSMUST00000015800 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Tbx21-201ENSMUST00000001484 2488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Msmo1-201ENSMUST00000034015 2044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Frrs1l-201ENSMUST00000053681 6817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Cadm1-204ENSMUST00000114548 4482 ntTSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Pick1-206ENSMUST00000166155 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Gm9694-201ENSMUST00000193347 1189 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Cox4i1-201ENSMUST00000034276 745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 AC124581.1-201ENSMUST00000225416 1399 ntBASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.13■□□□□ 0.49
Ifnb1P01575 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC18.12■□□□□ 0.49
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 30.2 ms