Protein–RNA interactions for Protein: O89090

Sp1, Transcription factor Sp1, mousemouse

Predictions only

Length 784 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sp1O89090 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp1O89090 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp1O89090 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp1O89090 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
Sp1O89090 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Fam43b-201ENSMUST00000105032 2437 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 D3Ertd751e-205ENSMUST00000120167 773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 AA414768-201ENSMUST00000121924 1257 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Coq7-201ENSMUST00000032887 914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Tfap2a-208ENSMUST00000224999 2058 ntAPPRIS ALT1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Ncor1-203ENSMUST00000069456 3171 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Klhdc8b-214ENSMUST00000195435 1612 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Nsmf-204ENSMUST00000102931 2830 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Cebpg-202ENSMUST00000130491 4709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Smu1-201ENSMUST00000030117 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Nol4l-201ENSMUST00000035346 6399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Acot7-206ENSMUST00000167926 1505 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Paxip1-201ENSMUST00000002291 5850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Cdpf1-204ENSMUST00000144067 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Pfdn6-201ENSMUST00000025163 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Olfr315-201ENSMUST00000081533 998 ntAPPRIS P1 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Zfp697-201ENSMUST00000056096 5166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Clint1-201ENSMUST00000109260 3311 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gm7609-201ENSMUST00000113402 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Wnk2-202ENSMUST00000049265 6738 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Epc2-201ENSMUST00000092123 4697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Mrpl43-201ENSMUST00000097715 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Nudt11-201ENSMUST00000103007 3036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Mprip-201ENSMUST00000066330 7765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Slc25a47-202ENSMUST00000221080 1890 ntTSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Pkp4-210ENSMUST00000168631 4484 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.37■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Fam53a-201ENSMUST00000045329 2346 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Zfp768-201ENSMUST00000060783 2356 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gm17349-201ENSMUST00000163472 300 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Qdpr-208ENSMUST00000197946 1206 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Hint2-201ENSMUST00000030192 610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Zfpm1-201ENSMUST00000054052 3390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Ube2d1-201ENSMUST00000020085 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.36■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Lancl2-202ENSMUST00000072954 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Rab3d-202ENSMUST00000119055 694 ntTSL 3 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Zfp629-206ENSMUST00000132524 215 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Tppp3-201ENSMUST00000014990 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Pdrg1-201ENSMUST00000028972 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Grcc10-201ENSMUST00000004389 863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Mtnr1b-201ENSMUST00000057920 1095 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Rplp2-201ENSMUST00000084434 964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Paox-202ENSMUST00000097967 1024 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Fmnl2-203ENSMUST00000090952 5414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Dab2-208ENSMUST00000160134 1374 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Lmo4-203ENSMUST00000121796 1417 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Sp1O89090 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29 ms