Protein–RNA interactions for Protein: O89020

Afm, Afamin, mousemouse

Predictions only

Length 608 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AfmO89020 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Mrps28-201ENSMUST00000042148 783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Rprml-201ENSMUST00000057870 1010 ntAPPRIS P1 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Camk2d-228ENSMUST00000200171 5396 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 1700096K18Rik-201ENSMUST00000188465 1454 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Bmi1-201ENSMUST00000028071 3594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
AfmO89020 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Sap18-201ENSMUST00000111267 660 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Khdc3-204ENSMUST00000173734 1228 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Rps28-201ENSMUST00000087342 392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Faap20-201ENSMUST00000097747 1479 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
AfmO89020 Fam71e1-202ENSMUST00000205359 1307 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Tulp1-201ENSMUST00000041819 2017 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Tpsg1-202ENSMUST00000160377 1040 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Lins1-203ENSMUST00000121777 2729 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
AfmO89020 Stox1-202ENSMUST00000133371 3510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm43799-201ENSMUST00000201845 579 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 AC120002.2-201ENSMUST00000220205 773 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Il3ra-202ENSMUST00000223589 738 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Cacna1a-202ENSMUST00000122053 7589 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Pagr1a-202ENSMUST00000200948 1430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm42742-205ENSMUST00000202798 1412 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm16120-201ENSMUST00000127990 808 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Col15a1-201ENSMUST00000082303 5102 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
AfmO89020 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ppm1a-201ENSMUST00000021514 7668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Krtap5-1-202ENSMUST00000188274 742 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Eepd1-201ENSMUST00000040677 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Cspg5-202ENSMUST00000196060 3790 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
AfmO89020 Ppp1r1b-204ENSMUST00000137634 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.7 ms