Protein–RNA interactions for Protein: O88879

Apaf1, Apoptotic protease-activating factor 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apaf1O88879 Bdkrb1-202ENSMUST00000182899 1313 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Bdkrb1-201ENSMUST00000041229 1338 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Tm7sf3-201ENSMUST00000037709 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Bola2-203ENSMUST00000130498 1266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Cep170b-202ENSMUST00000101018 6641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Trim25-202ENSMUST00000100627 1433 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Derl3-201ENSMUST00000009236 1321 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Syt7-203ENSMUST00000169121 6834 ntTSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm5414-201ENSMUST00000062879 1659 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Skp1a-203ENSMUST00000109072 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm16061-201ENSMUST00000122167 857 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gm17949-201ENSMUST00000210548 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Col9a3-203ENSMUST00000132527 3046 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Slc22a12-201ENSMUST00000113451 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Adcy2-201ENSMUST00000022013 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Trak1-209ENSMUST00000210798 5363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Nptn-212ENSMUST00000177292 1390 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gbe1-206ENSMUST00000170464 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Olfr279-201ENSMUST00000050451 933 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Sept9-201ENSMUST00000019038 3784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Casp9-201ENSMUST00000030747 3897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 AA467197-202ENSMUST00000110512 751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Eme2-202ENSMUST00000121542 1521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Dennd3-201ENSMUST00000043414 5299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Blmh-201ENSMUST00000021197 2497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Fam229a-201ENSMUST00000106043 558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Psmd13-209ENSMUST00000164681 726 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Metrn-201ENSMUST00000002344 987 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
Apaf1O88879 Gna11-201ENSMUST00000043604 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Zbtb24-202ENSMUST00000213797 2734 ntTSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Fxr1-201ENSMUST00000001620 2459 ntTSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Hspa1l-201ENSMUST00000007248 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Snap91-201ENSMUST00000036347 4237 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Dbndd2-201ENSMUST00000017878 1338 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Nudt16-201ENSMUST00000035179 1631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Prickle4-201ENSMUST00000113299 990 ntTSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Prickle4-202ENSMUST00000113300 1110 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Pabpc1l2b-ps-201ENSMUST00000124538 690 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Arpc4-204ENSMUST00000204802 794 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Gnb1-203ENSMUST00000165335 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Matn4-202ENSMUST00000103104 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Atp6v1b1-206ENSMUST00000206911 1591 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Apaf1O88879 Tm4sf19-201ENSMUST00000115149 1257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 37.9 ms