Protein–RNA interactions for Protein: O88855

Ltb4r, Leukotriene B4 receptor 1, mousemouse

Predictions only

Length 351 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ltb4rO88855 Gm6345-202ENSMUST00000180900 204 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
Ltb4rO88855 Pdcd2-201ENSMUST00000054450 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ltb4rO88855 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ltb4rO88855 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ltb4rO88855 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ltb4rO88855 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ltb4rO88855 Larp4b-201ENSMUST00000091829 5720 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
Ltb4rO88855 Phf20l1-201ENSMUST00000048188 6670 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Irx5-201ENSMUST00000034184 2450 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Ndufaf8-201ENSMUST00000106223 781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Eif4e2-205ENSMUST00000113232 1125 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gpha2-202ENSMUST00000113526 762 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm25016-201ENSMUST00000158399 131 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm43791-201ENSMUST00000202914 468 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gpha2-201ENSMUST00000025698 609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Inmt-201ENSMUST00000003569 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Birc5-201ENSMUST00000081387 947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Zfp524-201ENSMUST00000086349 1142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Tgfb1-201ENSMUST00000002678 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Ndufv3-201ENSMUST00000046288 1537 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Tm6sf2-202ENSMUST00000110160 1446 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Ppp1cb-201ENSMUST00000015100 5962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Mrpl37-201ENSMUST00000030365 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 4930540M05Rik-201ENSMUST00000180527 2068 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Itgb5-202ENSMUST00000115028 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Sulf2-201ENSMUST00000088086 3927 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Mzt2-202ENSMUST00000117136 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 4930465K10Rik-201ENSMUST00000056675 1238 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Fgf9-202ENSMUST00000074654 1198 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Shroom3-211ENSMUST00000225438 5742 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Auh-201ENSMUST00000021913 1320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Ism1-202ENSMUST00000184404 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Dlgap2-203ENSMUST00000133298 4503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Nr1d2-201ENSMUST00000090543 4663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Lce1j-201ENSMUST00000107304 420 ntAPPRIS P1 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm21362-201ENSMUST00000194272 928 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm7367-201ENSMUST00000057611 492 ntBASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Cdkn2c-201ENSMUST00000063531 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Lifr-202ENSMUST00000164529 2844 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Mid1-203ENSMUST00000079443 2815 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Rnf157-201ENSMUST00000100202 4619 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Hmg20b-213ENSMUST00000167481 1321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Ndufa10-201ENSMUST00000027478 2020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 4930452B06Rik-201ENSMUST00000102996 2681 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Socs6-203ENSMUST00000125362 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Itsn1-201ENSMUST00000056482 5364 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Dcaf5-201ENSMUST00000054145 5706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 1700024G13Rik-201ENSMUST00000100723 850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Mink1-205ENSMUST00000102559 4865 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Hist1h2bj-201ENSMUST00000110452 463 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Hist1h2bp-202ENSMUST00000110473 621 ntTSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Psma6-201ENSMUST00000021412 1042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Hist1h2bm-201ENSMUST00000224651 524 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Man1c1-201ENSMUST00000038628 4285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Tsr3-201ENSMUST00000063574 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Ldlrad1-201ENSMUST00000094916 1093 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Kbtbd13-201ENSMUST00000068307 2969 ntAPPRIS P1 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Cckbr-201ENSMUST00000033189 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Mex3b-201ENSMUST00000082237 3355 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Iqsec2-207ENSMUST00000168786 5993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Arhgap35-201ENSMUST00000075845 9147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Sbf1-205ENSMUST00000144585 6165 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Csnk2a2-203ENSMUST00000212214 6779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
Ltb4rO88855 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 35.2 ms