Protein–RNA interactions for Protein: O88848

Arl6, ADP-ribosylation factor-like protein 6, mousemouse

Predictions only

Length 186 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arl6O88848 Rflnb-201ENSMUST00000021207 3512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Kif17-204ENSMUST00000105821 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Ankrd44-210ENSMUST00000179030 6140 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 H2afy2-201ENSMUST00000020283 2175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Gm16499-203ENSMUST00000204633 2177 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Gpr137-202ENSMUST00000099774 1434 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 A230103J11Rik-202ENSMUST00000156084 2086 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Usp43-202ENSMUST00000108677 4447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Lrrfip2-207ENSMUST00000197256 1819 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Txnrd2-215ENSMUST00000206151 2874 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Chst8-204ENSMUST00000205259 1980 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Serbp1-211ENSMUST00000204293 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Arl6O88848 Clvs2-201ENSMUST00000019920 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ext2-201ENSMUST00000028623 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Wac-215ENSMUST00000171042 2205 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Srsf6-202ENSMUST00000126163 515 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Elof1-204ENSMUST00000214394 567 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Grwd1-201ENSMUST00000107723 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Six3os1-212ENSMUST00000177220 5601 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 1700034J05Rik-202ENSMUST00000111622 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rbm26-202ENSMUST00000100327 3634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rffl-202ENSMUST00000071152 3633 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Plaa-201ENSMUST00000107107 2784 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ankrd44-201ENSMUST00000044359 6192 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Kbtbd2-202ENSMUST00000114323 3816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 9130019P16Rik-202ENSMUST00000145111 4486 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ret-202ENSMUST00000088790 4497 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Tll1-201ENSMUST00000066166 4767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Med18-201ENSMUST00000102567 1675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Tmem119-201ENSMUST00000067853 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ntsr2-202ENSMUST00000220892 846 ntTSL 3 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mcrip2-201ENSMUST00000026828 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Usp32-202ENSMUST00000108075 7053 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 B230219D22Rik-201ENSMUST00000057844 4652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Sec31a-201ENSMUST00000094578 4228 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Fosl2-201ENSMUST00000031017 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Dnal4-201ENSMUST00000023055 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mon1b-201ENSMUST00000035777 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ggnbp2-203ENSMUST00000108081 3034 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Pi4k2b-202ENSMUST00000031082 3034 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rptor-201ENSMUST00000026671 6594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 5730480H06Rik-205ENSMUST00000196950 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Dmtn-201ENSMUST00000022694 5418 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rassf3-201ENSMUST00000026902 3522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Bcor-203ENSMUST00000115512 6887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Espn-212ENSMUST00000105658 2815 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Adap2-201ENSMUST00000021050 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Matn4-201ENSMUST00000103103 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Tnip2-202ENSMUST00000087737 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Epb41l1-204ENSMUST00000103137 6490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Galnt18-202ENSMUST00000106663 2530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Chpf-202ENSMUST00000094818 3065 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Taf6l-212ENSMUST00000177216 2167 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mzf1-202ENSMUST00000182087 2197 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Psip1-201ENSMUST00000030207 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rps14-202ENSMUST00000118551 602 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Josd2-218ENSMUST00000206887 693 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 CT030146.1-201ENSMUST00000220919 217 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Git2-215ENSMUST00000178440 4944 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Git2-201ENSMUST00000043283 4938 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Capn10-201ENSMUST00000027488 2902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Kctd20-208ENSMUST00000168507 2400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gm16638-201ENSMUST00000148687 1865 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Wdr91-201ENSMUST00000081214 2682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Arpc5-201ENSMUST00000077755 1914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Gpaa1-201ENSMUST00000023221 2107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Pcmt1-208ENSMUST00000162606 2757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Fyn-201ENSMUST00000063091 3562 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ppp2r5e-201ENSMUST00000021447 4810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Cops7b-201ENSMUST00000027446 2231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Nt5c3b-204ENSMUST00000107398 1635 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mcoln2-202ENSMUST00000098524 2492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Agbl3-205ENSMUST00000115017 3719 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Mios-201ENSMUST00000040017 3710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Tmem5-205ENSMUST00000140299 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Prodh-206ENSMUST00000139861 677 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Bsg-205ENSMUST00000179781 1261 ntTSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Ap4s1-201ENSMUST00000021338 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Arl6O88848 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.8 ms