Protein–RNA interactions for Protein: O88746

Tom1, Target of Myb protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 492 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tom1O88746 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Lmtk3-201ENSMUST00000072580 4807 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Ager-209ENSMUST00000174496 1347 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Acvr1b-201ENSMUST00000000544 4413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Epo-202ENSMUST00000111038 855 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm4535-201ENSMUST00000182274 558 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 6030443J06Rik-204ENSMUST00000195898 786 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gdpd3-201ENSMUST00000032944 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Rangrf-201ENSMUST00000038644 820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Olfr601-201ENSMUST00000080474 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm10355-201ENSMUST00000097146 517 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Zbed3-202ENSMUST00000221807 1945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Nisch-221ENSMUST00000171735 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Riox1-201ENSMUST00000053744 2344 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Tmem141-205ENSMUST00000142087 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm26646-202ENSMUST00000205705 439 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Rpl27-201ENSMUST00000077856 614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Nmur1-203ENSMUST00000212541 1534 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm4737-201ENSMUST00000059524 2093 ntAPPRIS P1 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Spout1-201ENSMUST00000100220 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gabarapl1-201ENSMUST00000032264 1820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Nudt3-201ENSMUST00000025050 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 1700025L06Rik-203ENSMUST00000211477 1623 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 AC159641.1-201ENSMUST00000221117 177 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Tubb6-201ENSMUST00000001513 1757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Spata18-202ENSMUST00000071077 1978 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Ccnd3-218ENSMUST00000183177 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Schip1-203ENSMUST00000170788 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Selenoh-201ENSMUST00000102646 783 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Baiap2l2-201ENSMUST00000165408 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Gm27628-201ENSMUST00000184911 107 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Selenoh-206ENSMUST00000189988 390 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Cfd-202ENSMUST00000217837 871 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Tesc-201ENSMUST00000031304 1031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Tom1O88746 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Picalm-212ENSMUST00000208730 3427 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Fam71b-201ENSMUST00000063166 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Tubb4b-ps1-201ENSMUST00000179460 1336 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gnpda1-201ENSMUST00000063814 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Phf7-203ENSMUST00000226565 1971 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Tha1-201ENSMUST00000033230 1770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Washc3-203ENSMUST00000182183 838 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Rpl31-205ENSMUST00000194746 703 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Cela3a-201ENSMUST00000024200 958 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gins1-201ENSMUST00000028948 1087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Chmp2a-201ENSMUST00000005711 949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 2410002F23Rik-217ENSMUST00000188111 2131 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Habp4-201ENSMUST00000021929 2564 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Mef2b-203ENSMUST00000110143 1312 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Mef2b-204ENSMUST00000110146 1342 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Msantd3-202ENSMUST00000064807 1378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm14701-201ENSMUST00000117156 348 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Edn3-203ENSMUST00000140908 731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Sod1-201ENSMUST00000023707 646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Vgf-202ENSMUST00000186451 2277 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Faxc-201ENSMUST00000029908 2627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Pdp1-206ENSMUST00000108302 2525 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Pank2-204ENSMUST00000150843 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Strn3-201ENSMUST00000013130 3046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Sh3yl1-201ENSMUST00000020997 1750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Jdp2-202ENSMUST00000171754 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Tgds-204ENSMUST00000228543 1594 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm16054-201ENSMUST00000139469 1819 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Lefty1-201ENSMUST00000037361 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Eif2b4-203ENSMUST00000166769 1878 ntTSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Nup188-205ENSMUST00000138666 534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm11025-201ENSMUST00000140773 466 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 1700023H06Rik-201ENSMUST00000161006 1044 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Gm6550-201ENSMUST00000187574 993 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Spr-201ENSMUST00000045986 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Cyp2w1-201ENSMUST00000031521 1512 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Tom1O88746 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.2 ms