Protein–RNA interactions for Protein: O88700

Blm, Bloom syndrome protein homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,416 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BlmO88700 Larp6-201ENSMUST00000038407 2440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BlmO88700 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BlmO88700 Haus4-201ENSMUST00000022784 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
BlmO88700 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
BlmO88700 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BlmO88700 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.41■■□□□ 1.82
BlmO88700 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BlmO88700 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BlmO88700 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
BlmO88700 Gm12359-202ENSMUST00000141696 713 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Gm12359-203ENSMUST00000153181 680 ntTSL 3 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Fam222a-201ENSMUST00000043650 2930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
BlmO88700 Prr3-202ENSMUST00000165613 767 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BlmO88700 Lce1a1-201ENSMUST00000074142 705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BlmO88700 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BlmO88700 Marcks-201ENSMUST00000092584 4048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BlmO88700 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BlmO88700 Il17rb-201ENSMUST00000016110 2061 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
BlmO88700 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm5953-201ENSMUST00000220644 2616 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Spg7-209ENSMUST00000149248 2896 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Adgrv1-207ENSMUST00000128585 2580 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Cgrrf1-204ENSMUST00000140114 419 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Lce1k-201ENSMUST00000179917 663 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm27459-201ENSMUST00000184860 107 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 AC122351.1-201ENSMUST00000220467 126 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Angptl8-201ENSMUST00000058777 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
BlmO88700 Rsph6a-201ENSMUST00000035521 2354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Nr2f1-201ENSMUST00000091458 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Anapc5-208ENSMUST00000197719 2383 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Slc9a6-201ENSMUST00000077741 4976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Mansc4-201ENSMUST00000100780 1125 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm13186-201ENSMUST00000118031 316 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Fbxo6-208ENSMUST00000168503 1240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm26661-201ENSMUST00000181025 471 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Ano10-206ENSMUST00000216670 2108 ntTSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gnb2-203ENSMUST00000111023 1471 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BlmO88700 Tmem44-204ENSMUST00000140402 2405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BlmO88700 Zkscan4-202ENSMUST00000225845 1506 ntBASIC26.37■■□□□ 1.81
BlmO88700 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
BlmO88700 Dlg1-205ENSMUST00000115201 3248 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm21949-201ENSMUST00000182006 2369 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
BlmO88700 4930474H06Rik-201ENSMUST00000132822 1590 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Rad23a-202ENSMUST00000109761 1842 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm43042-201ENSMUST00000198676 1820 ntTSL 5 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gpr142-202ENSMUST00000106584 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gpr142-201ENSMUST00000045319 1098 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Dexi-203ENSMUST00000184863 2537 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Adpgk-205ENSMUST00000217570 2484 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
BlmO88700 Hsd17b1-201ENSMUST00000019445 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Isyna1-204ENSMUST00000210005 1914 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Cacnb3-201ENSMUST00000003442 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Zdhhc6-207ENSMUST00000224897 2168 ntAPPRIS P1 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Gm13884-201ENSMUST00000118103 829 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 AW822252-206ENSMUST00000208904 237 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Ppp2r2d-207ENSMUST00000155672 1938 ntTSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Helt-201ENSMUST00000058636 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Prdm8-202ENSMUST00000210477 3316 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.35■■□□□ 1.81
BlmO88700 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Ubxn11-202ENSMUST00000074690 1573 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Sytl3-204ENSMUST00000159880 1296 ntTSL 5 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 AC125350.1-201ENSMUST00000225115 903 ntBASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Hist1h2ad-201ENSMUST00000090776 572 ntAPPRIS P1 BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Alas2-201ENSMUST00000066337 2037 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.34■■□□□ 1.81
BlmO88700 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Abhd5-202ENSMUST00000111497 2576 ntTSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Abcg5-202ENSMUST00000163375 1613 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Foxp1-230ENSMUST00000177437 2468 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Slc19a2-204ENSMUST00000169394 894 ntTSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.33■■□□□ 1.81
BlmO88700 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.33■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.4 ms