Protein–RNA interactions for Protein: O88609

Lmx1b, LIM homeobox transcription factor 1-beta, mousemouse

Predictions only

Length 395 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lmx1bO88609 Map3k10-201ENSMUST00000036453 3682 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Fbrsl1-206ENSMUST00000198834 2571 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Ttc13-201ENSMUST00000041614 3038 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 9030624G23Rik-201ENSMUST00000101538 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Apbb1-209ENSMUST00000188368 1970 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Pea15a-201ENSMUST00000013842 2501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Pigu-201ENSMUST00000077626 1636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
Lmx1bO88609 A230050P20Rik-201ENSMUST00000043911 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Sapcd2-202ENSMUST00000100323 1761 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Nmnat3-203ENSMUST00000112938 848 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Sae1-203ENSMUST00000210999 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm11273-201ENSMUST00000044043 390 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 2810459M11Rik-202ENSMUST00000165824 3331 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ppp2r5d-201ENSMUST00000002839 2926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ggt6-202ENSMUST00000100903 1387 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Aig1-201ENSMUST00000019942 1439 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Tacc3-203ENSMUST00000114426 2187 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Aig1-205ENSMUST00000162610 1554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Dock9-202ENSMUST00000100299 6476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Slc35e1-202ENSMUST00000152080 4383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 H13-204ENSMUST00000125366 5204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm7638-201ENSMUST00000121348 967 ntBASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm16105-201ENSMUST00000156926 697 ntTSL 3 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Cnih3-204ENSMUST00000209607 564 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Stk11-210ENSMUST00000213772 1239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Banf1-201ENSMUST00000025762 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ewsr1-204ENSMUST00000093365 1290 ntTSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm15408-201ENSMUST00000124198 1379 ntTSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ispd-201ENSMUST00000062041 2690 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.57■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Irgq-201ENSMUST00000049020 6083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Camsap3-206ENSMUST00000207533 2584 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Armc10-202ENSMUST00000095495 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 March11-203ENSMUST00000152841 1365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Pmpcb-201ENSMUST00000030882 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Arl1-202ENSMUST00000116234 2080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Arpc4-201ENSMUST00000156898 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ttyh3-202ENSMUST00000197452 4576 ntTSL 1 (best) BASIC15.56■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Chpt1-201ENSMUST00000020253 3898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Rmnd1-201ENSMUST00000042251 3139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Pdx1-201ENSMUST00000085591 2158 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ets1-206ENSMUST00000184887 2107 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Zfp119b-201ENSMUST00000056147 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 1700041G16Rik-202ENSMUST00000186344 1824 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Hpn-209ENSMUST00000168884 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Snx3-202ENSMUST00000105499 1057 ntTSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm6659-201ENSMUST00000174752 547 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm20033-201ENSMUST00000180470 572 ntTSL 3 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm45058-201ENSMUST00000205810 766 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm9745-201ENSMUST00000021573 684 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm7791-201ENSMUST00000219066 539 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 AC122335.2-201ENSMUST00000213901 6181 ntBASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Kmt5c-201ENSMUST00000098853 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ubac2-201ENSMUST00000039803 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Glrx2-210ENSMUST00000185362 3337 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ep300-201ENSMUST00000068387 9566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.55■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Tmem81-201ENSMUST00000058167 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Fam126a-202ENSMUST00000101513 1679 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Kcns2-201ENSMUST00000072868 5456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Lhx6-205ENSMUST00000112967 3378 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Csf3-201ENSMUST00000038886 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Mtss1l-201ENSMUST00000052457 4717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm1673-202ENSMUST00000114382 451 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Cebpg-201ENSMUST00000070191 914 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Mapre3-201ENSMUST00000031058 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Fam69a-201ENSMUST00000031198 2721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Myb-201ENSMUST00000020158 3074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Gm6093-201ENSMUST00000221792 1623 ntTSL 1 (best) BASIC15.54■□□□□ 0.08
Lmx1bO88609 Ercc6l2-203ENSMUST00000067821 2743 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.8 ms