Protein–RNA interactions for Protein: O88509

Dnmt3b, DNA (cytosine-5)-methyltransferase 3B, mousemouse

Predictions only

Length 859 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dnmt3bO88509 Cst3-201ENSMUST00000028938 860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Ccdc107-201ENSMUST00000030181 817 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cox8a-201ENSMUST00000039758 545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Plpp1-202ENSMUST00000070951 1272 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 CT010478.1-201ENSMUST00000220747 2787 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Tbx3os2-201ENSMUST00000135385 1345 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Lrg1-201ENSMUST00000041357 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Luc7l2-213ENSMUST00000163047 3141 ntTSL 1 (best) BASIC16.61■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Rtn3-201ENSMUST00000025667 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Fads3-201ENSMUST00000115995 3269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Thegl-202ENSMUST00000117880 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Itsn1-206ENSMUST00000113999 5393 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm11527-201ENSMUST00000153795 596 ntTSL 2 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 2510002D24Rik-204ENSMUST00000191388 995 ntTSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Med7-209ENSMUST00000170928 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Smox-209ENSMUST00000110189 1919 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 AC125311.2-201ENSMUST00000227477 1940 ntBASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Larp1-201ENSMUST00000071487 6614 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Crtac1-201ENSMUST00000048630 2616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cbl-204ENSMUST00000205968 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.6■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Mybl2-201ENSMUST00000018005 3651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cdipt-201ENSMUST00000032920 1974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Ppm1h-206ENSMUST00000161487 2931 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Ost4-201ENSMUST00000132034 576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm45736-201ENSMUST00000210592 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Slc16a3-202ENSMUST00000100130 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Rgs9-201ENSMUST00000020920 2434 ntTSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Tsc22d1-214ENSMUST00000177207 1476 ntTSL 3 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Zbtb5-204ENSMUST00000180217 4708 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Zbtb7a-201ENSMUST00000048128 5938 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Zfp219-212ENSMUST00000228580 2812 ntAPPRIS ALT2 BASIC16.59■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Trim8-201ENSMUST00000026008 3230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Cdk5-201ENSMUST00000030814 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Adgra2-202ENSMUST00000178514 5129 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Igsf8-201ENSMUST00000039506 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Add1-204ENSMUST00000114338 4007 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gch1-201ENSMUST00000089959 2775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Gm16835-201ENSMUST00000140488 2809 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.25
Dnmt3bO88509 Il6st-206ENSMUST00000183886 3004 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Josd2-205ENSMUST00000120852 727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm20390-201ENSMUST00000170303 991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Cldn14-205ENSMUST00000177648 1266 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 4930554C24Rik-202ENSMUST00000216019 1159 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Crybb1-201ENSMUST00000031286 882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Id1-201ENSMUST00000038368 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Hspbp1-201ENSMUST00000079970 1593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Ndel1-203ENSMUST00000108672 1653 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Galnt16-204ENSMUST00000218943 2047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Fbxo9-202ENSMUST00000085311 2155 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Dnah9-202ENSMUST00000108691 2671 ntTSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Glt28d2-201ENSMUST00000033643 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Parg-204ENSMUST00000164137 3013 ntTSL 5 BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gna12-201ENSMUST00000000153 3416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Bmt2-201ENSMUST00000045235 4143 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Plekhg3-201ENSMUST00000075249 5138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.58■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Inppl1-202ENSMUST00000165052 4730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Cactin-201ENSMUST00000050867 2715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Galnt18-201ENSMUST00000049430 2575 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Spata6-201ENSMUST00000038868 2466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm21974-201ENSMUST00000126662 2037 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Tmem125-201ENSMUST00000060214 1864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Brpf1-204ENSMUST00000113122 4773 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Nsfl1c-203ENSMUST00000103160 1369 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Spock1-201ENSMUST00000172326 1320 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gas5-203ENSMUST00000159119 665 ntTSL 5 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 B230208B08Rik-201ENSMUST00000173049 404 ntTSL 3 BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm10698-201ENSMUST00000182663 604 ntBASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 2510002D24Rik-201ENSMUST00000055413 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Psmd4-201ENSMUST00000071664 1276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Pstk-201ENSMUST00000075610 1135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Kansl1l-201ENSMUST00000068168 4459 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Carmil2-201ENSMUST00000062574 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Cul1-201ENSMUST00000031697 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.57■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Krt19-201ENSMUST00000007317 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Prkcb-201ENSMUST00000064921 2557 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Nrxn2-204ENSMUST00000113461 5505 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Slc13a3-202ENSMUST00000109279 3131 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Atox1-201ENSMUST00000108857 541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 Gm19610-201ENSMUST00000202894 408 ntTSL 1 (best) BASIC16.56■□□□□ 0.24
Dnmt3bO88509 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC16.56■□□□□ 0.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 28 ms