Protein–RNA interactions for Protein: O88507

Cntfr, Ciliary neurotrophic factor receptor subunit alpha, mousemouse

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Length 372 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CntfrO88507 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Klf16-201ENSMUST00000038558 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Usp48-201ENSMUST00000055131 5722 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Syt8-202ENSMUST00000105976 1289 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ablim1-204ENSMUST00000111524 1251 ntTSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 AC159205.6-201ENSMUST00000224935 887 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 AC158538.1-201ENSMUST00000225870 294 ntBASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Klhdc8a-201ENSMUST00000046071 4269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ctnnbip1-201ENSMUST00000030839 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Eri1-201ENSMUST00000033927 5079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.93□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Rbm24-201ENSMUST00000037923 3086 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Man2a1-201ENSMUST00000086723 6991 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Snrnp48-201ENSMUST00000091641 1785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Tia1-203ENSMUST00000095754 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gapdh-202ENSMUST00000117757 1273 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Slc25a3-201ENSMUST00000076694 1612 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Bcor-206ENSMUST00000124033 6785 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 A930029G22Rik-201ENSMUST00000181032 1710 ntTSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Dhx15-201ENSMUST00000031061 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gpaa1-210ENSMUST00000172281 1809 ntTSL 5 BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Foxo3-204ENSMUST00000175881 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.92□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ppp1r3f-205ENSMUST00000150787 4760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Avl9-201ENSMUST00000031805 6670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Slc2a8-204ENSMUST00000153484 1168 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Olfr464-201ENSMUST00000074874 1084 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm8994-201ENSMUST00000077886 1236 ntAPPRIS P1 BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Smad5-203ENSMUST00000109876 4570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Rnf112-203ENSMUST00000102661 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Itpkb-201ENSMUST00000070181 6235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 2810004N23Rik-201ENSMUST00000034465 2340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.91□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Dusp8-201ENSMUST00000039926 4804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Dzip3-202ENSMUST00000121869 5820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Cask-203ENSMUST00000115436 8260 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm3488-202ENSMUST00000181562 1945 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Hist1h4a-201ENSMUST00000102964 539 ntAPPRIS P1 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Fuz-209ENSMUST00000208179 1164 ntTSL 5 BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Rgcc-201ENSMUST00000022595 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Plekhf2-201ENSMUST00000054776 2977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Chst2-201ENSMUST00000036267 7328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Nfatc3-201ENSMUST00000109308 5984 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.18
CntfrO88507 Otud5-201ENSMUST00000033494 4259 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.9□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pard3-209ENSMUST00000160272 5815 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Tsc22d1-201ENSMUST00000022587 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Pdlim5-211ENSMUST00000198381 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Lhx6-208ENSMUST00000148852 1481 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ocel1-203ENSMUST00000110052 5285 ntTSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Cutc-202ENSMUST00000112047 1233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Mpc2-201ENSMUST00000027853 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 BC048679-201ENSMUST00000073406 522 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Nf2-205ENSMUST00000109910 4720 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.89□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Nptxr-203ENSMUST00000175858 4948 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Klhl25-201ENSMUST00000092073 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
CntfrO88507 Ppp1r9b-201ENSMUST00000038696 4508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.88□□□□□ -0.19
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