Protein–RNA interactions for Protein: O88456

Capns1, Calpain small subunit 1, mousemouse

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Length 269 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Capns1O88456 AC142113.1-201ENSMUST00000214931 801 ntTSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Foxi3-201ENSMUST00000069634 1206 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Capzb-202ENSMUST00000042675 1604 ntTSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Spc25-202ENSMUST00000112320 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.92■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm10435-202ENSMUST00000162526 2878 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Kat14-208ENSMUST00000147747 3299 ntTSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tmx1-201ENSMUST00000021471 2795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Zfp512b-201ENSMUST00000108789 5714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Speg-204ENSMUST00000113589 833 ntTSL 2 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 2900042K21Rik-201ENSMUST00000194444 653 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Mrpl10-202ENSMUST00000054252 744 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Krt9-201ENSMUST00000059707 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Bicc1-203ENSMUST00000143791 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm26580-201ENSMUST00000181002 2095 ntTSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tnrc6c-202ENSMUST00000106344 8847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.91■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Hmg20b-201ENSMUST00000020454 1621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 H2-Q4-201ENSMUST00000081435 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Col4a3bp-203ENSMUST00000179226 3040 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Mvk-201ENSMUST00000043760 1660 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 A830073O21Rik-202ENSMUST00000205693 3096 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Ino80e-202ENSMUST00000106342 1840 ntTSL 3 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Tjp1-202ENSMUST00000102592 7049 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Gm6211-202ENSMUST00000167849 925 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Trmt13-210ENSMUST00000198454 880 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rab28-205ENSMUST00000202913 863 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Cklf-203ENSMUST00000211809 525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 AC122769.4-201ENSMUST00000228166 901 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Hivep3-201ENSMUST00000084306 2973 ntBASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Dpm1-209ENSMUST00000154111 2293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 G3bp2-202ENSMUST00000164378 3026 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Stk39-201ENSMUST00000102715 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Setdb2-202ENSMUST00000111253 1774 ntTSL 2 BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 St3gal3-203ENSMUST00000106410 2225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Nagpa-203ENSMUST00000147567 2230 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Nploc4-202ENSMUST00000103017 4025 ntTSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Npnt-202ENSMUST00000042744 4619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.9■□□□□ 0.14
Capns1O88456 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Prmt1-203ENSMUST00000207370 2147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Mettl21a-201ENSMUST00000053469 2666 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Car11-201ENSMUST00000003360 1585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Mtcl1-202ENSMUST00000097291 7274 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Etv2-201ENSMUST00000108147 1048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Atp8a1-204ENSMUST00000113652 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gm6420-201ENSMUST00000193885 723 ntBASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gng10-201ENSMUST00000041160 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Sox15-201ENSMUST00000047373 861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Bex2-201ENSMUST00000049130 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Wdtc1-201ENSMUST00000043305 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Fam129c-208ENSMUST00000143662 2267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Etv6-201ENSMUST00000081028 5545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Guf1-202ENSMUST00000087228 3433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Pard6g-201ENSMUST00000070219 3143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ing1-202ENSMUST00000209565 1971 ntTSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Neu1-201ENSMUST00000007253 2474 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Rab6a-201ENSMUST00000032946 3214 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.89■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Zfp740-202ENSMUST00000119168 3932 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gm10655-201ENSMUST00000098658 1397 ntBASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 2010016I18Rik-204ENSMUST00000190356 1562 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Ift74-201ENSMUST00000030311 2139 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Slc27a4-201ENSMUST00000080065 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Mrps10-203ENSMUST00000119945 1018 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Nudt8-203ENSMUST00000122924 1082 ntTSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Pop5-201ENSMUST00000081497 1025 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Tbx20-202ENSMUST00000166018 1801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Grb7-201ENSMUST00000019456 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Idnk-202ENSMUST00000109868 1462 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Macrod2-202ENSMUST00000078027 1669 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Synpo-201ENSMUST00000097566 5060 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Galk2-202ENSMUST00000094604 1928 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.88■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Lrch4-204ENSMUST00000176667 2209 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Farsa-201ENSMUST00000003906 1826 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Nuak1-201ENSMUST00000020220 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Efcab11-201ENSMUST00000046485 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gm15155-201ENSMUST00000112542 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Fam135a-201ENSMUST00000027337 5536 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Pdcl3-201ENSMUST00000027247 3914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
Capns1O88456 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.87■□□□□ 0.13
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