Protein–RNA interactions for Protein: O88425

Nme6, Nucleoside diphosphate kinase 6, mousemouse

Predictions only

Length 189 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nme6O88425 Gm12896-201ENSMUST00000118430 226 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Arl4aos-201ENSMUST00000135883 748 ntTSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Hsbp1-202ENSMUST00000212468 638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 1110004E09Rik-201ENSMUST00000023694 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Exosc3-201ENSMUST00000030003 1077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm10602-201ENSMUST00000098239 609 ntBASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tacc1-201ENSMUST00000084030 7788 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Brpf1-203ENSMUST00000113121 4603 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Fxyd6-201ENSMUST00000085939 1788 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.8■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ptprt-201ENSMUST00000109441 6623 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Nrl-202ENSMUST00000111404 2422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Dcps-202ENSMUST00000119847 1445 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Cox18-201ENSMUST00000048363 1333 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Disp3-201ENSMUST00000047720 5282 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Amacr-201ENSMUST00000070877 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Sdr39u1-201ENSMUST00000111325 1255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Alkbh1-212ENSMUST00000185301 408 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tspan2-203ENSMUST00000196611 682 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm44210-201ENSMUST00000205253 713 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ndufa6-201ENSMUST00000023085 560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Yars2-204ENSMUST00000159962 2805 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Rhobtb1-202ENSMUST00000067908 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Serbp1-203ENSMUST00000203077 1617 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tlk1-201ENSMUST00000038584 4280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Nipsnap3b-201ENSMUST00000015391 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Rab11fip4-201ENSMUST00000017783 7156 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ppp1r36-201ENSMUST00000063977 1515 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 A930017K11Rik-201ENSMUST00000162431 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 BC051019-202ENSMUST00000106735 1957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Rapgef3-207ENSMUST00000134885 1422 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tnfsf13-201ENSMUST00000018896 1407 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 A930024E05Rik-201ENSMUST00000148466 1896 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Sh3rf3-205ENSMUST00000153031 5682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Socs4-201ENSMUST00000065562 6877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm6576-201ENSMUST00000169678 883 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 1700018M17Rik-201ENSMUST00000052502 456 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Mid2-202ENSMUST00000112990 6271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Tmtc4-209ENSMUST00000148661 2719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Yipf2-202ENSMUST00000078572 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Ntng1-209ENSMUST00000138344 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Slit1-201ENSMUST00000025993 5045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Eml1-203ENSMUST00000109860 4160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Igsf11-201ENSMUST00000023478 3443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Aspscr1-204ENSMUST00000106159 1615 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 A530084C06Rik-201ENSMUST00000170573 3200 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm6270-201ENSMUST00000132731 559 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Aldh1a3-204ENSMUST00000174215 1066 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 AC163280.1-201ENSMUST00000228194 1100 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Izumo2-201ENSMUST00000085422 632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
Nme6O88425 Zfp865-203ENSMUST00000085427 2751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Nat8l-201ENSMUST00000056355 6529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm19721-201ENSMUST00000195284 1764 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme6O88425 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Parg-208ENSMUST00000170840 2894 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Tbxas1-201ENSMUST00000003017 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gata5os-201ENSMUST00000069943 1678 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Slc22a3-201ENSMUST00000024595 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Sh3yl1-202ENSMUST00000110880 1601 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Slc6a17-208ENSMUST00000169449 6322 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Slc6a17-201ENSMUST00000029499 6308 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Fam126a-201ENSMUST00000030849 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Mrpl52-204ENSMUST00000199195 463 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Rab34-209ENSMUST00000207728 567 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Eif1a-202ENSMUST00000168382 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Ssu72-201ENSMUST00000030905 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Wapl-201ENSMUST00000048263 6351 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Smad3-201ENSMUST00000034973 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Gm16401-202ENSMUST00000197463 2074 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
Nme6O88425 Phldb3-201ENSMUST00000073325 2273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63.6 ms