Protein–RNA interactions for Protein: O88384

Vti1b, Vesicle transport through interaction with t-SNAREs homolog 1B, mousemouse

Predictions only

Length 232 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vti1bO88384 Vhl-201ENSMUST00000035673 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.43■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Col13a1-204ENSMUST00000105453 2935 ntTSL 2 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Camsap3-212ENSMUST00000208240 2572 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Atp1b1-201ENSMUST00000027863 2580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Zkscan3-204ENSMUST00000117721 5788 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Antxr2-201ENSMUST00000031281 5656 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Dhx32-201ENSMUST00000033290 2955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Vopp1-201ENSMUST00000114297 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tomm6-202ENSMUST00000113302 749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Stum-201ENSMUST00000136521 6506 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Kank1-201ENSMUST00000049400 5637 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Mtfr1l-202ENSMUST00000116279 1969 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm26657-201ENSMUST00000181745 1308 ntAPPRIS P1 BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Eda-202ENSMUST00000113775 5088 ntTSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 1600012H06Rik-203ENSMUST00000174004 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Whrn-201ENSMUST00000063650 4016 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.42■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rnf103-201ENSMUST00000064637 3264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Ddx51-201ENSMUST00000031478 4846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Podnl1-201ENSMUST00000093380 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Lrrc47-205ENSMUST00000169622 3468 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Dnajb14-201ENSMUST00000090178 9477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Txndc5-201ENSMUST00000035988 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Selenos-201ENSMUST00000101801 1191 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Svbp-203ENSMUST00000106345 684 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tmed5-204ENSMUST00000118036 1045 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm11927-201ENSMUST00000118472 759 ntBASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Moap1-202ENSMUST00000178384 1284 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rabac1-203ENSMUST00000205871 986 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gm45894-201ENSMUST00000211940 651 ntTSL 2 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Tmem126a-201ENSMUST00000032844 799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Espn-208ENSMUST00000105654 1566 ntTSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Gpn3-201ENSMUST00000031420 1592 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Acbd4-201ENSMUST00000024492 2075 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC16.41■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Mbnl1-201ENSMUST00000099087 5655 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Alcam-206ENSMUST00000168071 878 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Pantr1-210ENSMUST00000185599 343 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Entpd7-201ENSMUST00000081079 5911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Bcar1-201ENSMUST00000166232 3142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Atxn7l2-202ENSMUST00000117409 2321 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Apbb1-219ENSMUST00000191601 2690 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Snx11-202ENSMUST00000107661 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
Vti1bO88384 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Mfsd12-201ENSMUST00000044844 3971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Zfp668-203ENSMUST00000106262 3169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Piezo2-201ENSMUST00000046860 2849 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm16386-201ENSMUST00000181397 1423 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Cldn5-201ENSMUST00000043577 1414 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Slc7a10-201ENSMUST00000001854 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Yipf2-201ENSMUST00000034700 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Scamp4-202ENSMUST00000180350 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Tgfb2-201ENSMUST00000045288 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm11769-201ENSMUST00000140273 1657 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Ctcf-201ENSMUST00000005841 3782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Card10-203ENSMUST00000170584 3220 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Oxct2b-201ENSMUST00000102648 1735 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Paqr3-201ENSMUST00000069453 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Ptges3-202ENSMUST00000084771 1559 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Bean1-201ENSMUST00000093245 3199 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Nrxn1-216ENSMUST00000174331 6282 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Zfp764-201ENSMUST00000059199 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Cacng6-201ENSMUST00000108647 868 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm11249-201ENSMUST00000117071 859 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Arntl-204ENSMUST00000210238 2976 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Grp-201ENSMUST00000025395 862 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Hebp1-201ENSMUST00000045855 1058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Mrpl15-205ENSMUST00000146665 1569 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Met-203ENSMUST00000115443 6809 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Ric3-202ENSMUST00000120876 1633 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Agrn-206ENSMUST00000180572 6891 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Nfib-205ENSMUST00000107247 3267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 1110065P20Rik-203ENSMUST00000137769 659 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Vti1bO88384 AA465934-203ENSMUST00000177150 383 ntTSL 1 (best) BASIC16.37■□□□□ 0.21
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.4 ms