Protein–RNA interactions for Protein: O88207

Col5a1, Collagen alpha-1(V) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,838 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col5a1O88207 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Dgcr6-208ENSMUST00000153123 920 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Cspg5-205ENSMUST00000199736 2107 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Sult2b1-201ENSMUST00000075571 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Lsmem1-201ENSMUST00000095760 1213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Fbxo17-203ENSMUST00000108279 1563 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Maneal-201ENSMUST00000064444 2727 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Mff-202ENSMUST00000078332 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Pla2g2c-201ENSMUST00000030530 1618 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Trpc4ap-202ENSMUST00000103140 3091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm13285-201ENSMUST00000179725 1462 ntAPPRIS P1 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.53■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm16181-201ENSMUST00000118793 567 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm27002-201ENSMUST00000182789 620 ntTSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Spg21-202ENSMUST00000213957 1302 ntTSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Calb2-201ENSMUST00000003754 1431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gal3st1-201ENSMUST00000063004 1879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Tm2d3-202ENSMUST00000065574 1478 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC15.52■□□□□ 0.08
Col5a1O88207 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Dmtn-207ENSMUST00000228001 2437 ntBASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Adal-203ENSMUST00000110662 1231 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Mfap2-203ENSMUST00000166376 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Syne4-208ENSMUST00000176304 1006 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Pacsin1-204ENSMUST00000114873 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.52■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Racgap1-213ENSMUST00000171702 3052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gdf11-201ENSMUST00000026408 4062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Snhg4-201ENSMUST00000181664 1190 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Hmgb1-rs17-201ENSMUST00000210634 972 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 AC138767.1-201ENSMUST00000222661 415 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Vti1a-206ENSMUST00000225529 1244 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Nek4-204ENSMUST00000226833 1252 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Fam105a-203ENSMUST00000226170 3043 ntBASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Prmt2-202ENSMUST00000099571 2052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Mipol1-201ENSMUST00000123498 2117 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.51■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Rhbdd3-202ENSMUST00000101610 2333 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Rnf26-201ENSMUST00000056328 2724 ntAPPRIS P2 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Nudt21-204ENSMUST00000212981 1184 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Tmem205-201ENSMUST00000046831 785 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Sgta-201ENSMUST00000005067 1969 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Tm7sf2-201ENSMUST00000025713 1471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm11611-201ENSMUST00000134289 1326 ntTSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm15794-201ENSMUST00000120182 631 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Timm23-201ENSMUST00000013845 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Tmem33-206ENSMUST00000162543 664 ntTSL 1 (best) BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm45328-201ENSMUST00000210942 917 ntBASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Mrpl36-203ENSMUST00000222030 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.5■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm44618-201ENSMUST00000208431 2262 ntTSL 3 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Drap1-202ENSMUST00000113673 744 ntTSL 2 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Rps27l-203ENSMUST00000127896 575 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Ctsg-201ENSMUST00000015583 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm26039-201ENSMUST00000158152 144 ntBASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Mrpl34-201ENSMUST00000048914 607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Eif5a-203ENSMUST00000071026 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Trim45-202ENSMUST00000094048 1815 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Tmem79-201ENSMUST00000001456 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC15.49■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Klhl25-202ENSMUST00000171155 3403 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Stard6-201ENSMUST00000114959 1496 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Zfp623-201ENSMUST00000037260 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 2810425M01Rik-201ENSMUST00000180790 1850 ntTSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm27702-201ENSMUST00000184512 56 ntBASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Krtcap3-208ENSMUST00000201937 889 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm9991-201ENSMUST00000070048 1207 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm5145-201ENSMUST00000095633 837 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Coro1a-201ENSMUST00000032949 1660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Cenpw-201ENSMUST00000099985 1532 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC15.48■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm12895-201ENSMUST00000122214 226 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 4930570G19Rik-204ENSMUST00000149387 986 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 Gm40457-201ENSMUST00000205319 1174 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
Col5a1O88207 AC153889.1-201ENSMUST00000219257 330 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
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