Protein–RNA interactions for Protein: O70546

Kdm6a, Lysine-specific demethylase 6A, mousemouse

Predictions only

Length 1,401 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Kdm6aO70546 Ccdc69-201ENSMUST00000055040 1402 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 9930012K11Rik-205ENSMUST00000153871 1983 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 9930012K11Rik-201ENSMUST00000058240 1986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm16897-201ENSMUST00000180780 2492 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 1810010H24Rik-201ENSMUST00000106767 1100 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Naa10-204ENSMUST00000114389 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Pgpep1-208ENSMUST00000211715 676 ntTSL 3 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Ppp1r27-201ENSMUST00000026121 771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Lce1a2-201ENSMUST00000029530 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Matn4-204ENSMUST00000109359 2179 ntTSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Irf5-205ENSMUST00000167252 1693 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Fgf17-201ENSMUST00000022697 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Stk32c-202ENSMUST00000165870 1883 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rpl3l-202ENSMUST00000170239 1375 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rnf141-201ENSMUST00000106682 1101 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Cd82-204ENSMUST00000111257 1003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Epsti1-202ENSMUST00000169978 1175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm28402-201ENSMUST00000188574 373 ntTSL 3 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm44450-201ENSMUST00000199528 114 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Epsti1-203ENSMUST00000227903 1178 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Cldn19-201ENSMUST00000084309 924 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 5830415G21Rik-201ENSMUST00000192543 1332 ntBASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mis18bp1-202ENSMUST00000124201 717 ntTSL 3 BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Alkal1-201ENSMUST00000133144 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 2010010A06Rik-202ENSMUST00000186356 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rad51d-203ENSMUST00000092844 1228 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mark2-203ENSMUST00000051711 2867 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 1600012H06Rik-202ENSMUST00000164837 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Frmd3-202ENSMUST00000098006 2205 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mrm1-201ENSMUST00000018549 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mplkip-201ENSMUST00000049744 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Evc-202ENSMUST00000114148 2119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Tubg1-201ENSMUST00000043680 1802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Lcn12-202ENSMUST00000114245 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 E2f7-205ENSMUST00000173634 827 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Rpp40-202ENSMUST00000174230 1053 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Gm44930-202ENSMUST00000208733 689 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mrpl36-202ENSMUST00000221730 717 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 AC124569.2-201ENSMUST00000225998 818 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC22.08■■□□□ 1.13
Kdm6aO70546 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Dut-201ENSMUST00000051605 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Crhbp-201ENSMUST00000045583 1701 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Sdcbp-201ENSMUST00000029912 2745 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Prkcz-203ENSMUST00000105624 694 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Tulp3-205ENSMUST00000157005 1053 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm26644-201ENSMUST00000181365 958 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Astn2-202ENSMUST00000084496 4675 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Ybx2-202ENSMUST00000108601 1351 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm12359-201ENSMUST00000139017 1399 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Pitx2-207ENSMUST00000174661 1942 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Podxl-201ENSMUST00000026698 5379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 2310009B15Rik-201ENSMUST00000112025 565 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Xkr6-201ENSMUST00000119973 2963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Rnf5-201ENSMUST00000015622 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm17112-201ENSMUST00000163194 432 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Ankrd23-204ENSMUST00000194853 1073 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Timm8a2-201ENSMUST00000045976 913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm9857-201ENSMUST00000050914 393 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Sec61a2-202ENSMUST00000102981 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Trim33-202ENSMUST00000106860 5025 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Lca5l-201ENSMUST00000054855 2508 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Htr5b-201ENSMUST00000055884 1935 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Cyth2-202ENSMUST00000107729 2519 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Tmem198-202ENSMUST00000113575 2185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Adam22-205ENSMUST00000115385 2318 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Mpst-202ENSMUST00000167140 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm28051-201ENSMUST00000179306 445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm43077-201ENSMUST00000200602 491 ntTSL 3 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Ppib-201ENSMUST00000034947 892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Cebpzos-201ENSMUST00000063817 753 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Pdss2-201ENSMUST00000095725 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Secisbp2-202ENSMUST00000110044 1915 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Fam159b-201ENSMUST00000043061 1310 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm38119-201ENSMUST00000192027 755 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Gm38186-201ENSMUST00000192574 449 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Med14-201ENSMUST00000076016 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Kdm6aO70546 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms