Protein–RNA interactions for Protein: O70480

Vamp4, Vesicle-associated membrane protein 4, mousemouse

Predictions only

Length 141 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Vamp4O70480 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Gm16731-201ENSMUST00000132432 922 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Mir5130-201ENSMUST00000175160 84 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Spata25-201ENSMUST00000017911 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Dnajc2-201ENSMUST00000030771 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Spsb2-203ENSMUST00000112473 1322 ntBASIC21.72■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Cyp4f41-ps-201ENSMUST00000126790 1077 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Cog6-204ENSMUST00000193432 2078 ntTSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Epn1-201ENSMUST00000045277 2334 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Cables1-201ENSMUST00000046948 3202 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
Vamp4O70480 Hirip3-201ENSMUST00000037248 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm26697-201ENSMUST00000180898 1760 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Hmga1-206ENSMUST00000119486 1003 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 4930544I03Rik-201ENSMUST00000181184 1276 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gga2-201ENSMUST00000033160 4915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Rara-204ENSMUST00000107475 2469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ppp1r1b-201ENSMUST00000078694 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ppan-201ENSMUST00000004203 1670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gcat-202ENSMUST00000171999 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 2610035D17Rik-201ENSMUST00000127263 1861 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ckap4-202ENSMUST00000167671 2606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Il17re-201ENSMUST00000053569 1898 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Hist3h2ba-201ENSMUST00000078267 614 ntAPPRIS P1 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Nsun5-201ENSMUST00000000940 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Sec1-201ENSMUST00000040636 2470 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm20460-201ENSMUST00000168709 1572 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Elac2-202ENSMUST00000101049 2884 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Zc3h14-203ENSMUST00000110104 3146 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Zfyve19-201ENSMUST00000090174 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Dapk1-207ENSMUST00000226059 5009 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Echdc2-203ENSMUST00000116307 893 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm13836-201ENSMUST00000121159 501 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm21057-201ENSMUST00000206022 670 ntTSL 3 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm18032-201ENSMUST00000222541 538 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 AC121577.1-201ENSMUST00000227302 707 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Fam92a-201ENSMUST00000087052 1292 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm26676-201ENSMUST00000181877 2226 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Galnt1-206ENSMUST00000170243 4108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Trabd-201ENSMUST00000081702 2439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Btbd10-203ENSMUST00000119278 2394 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 4933402J07Rik-201ENSMUST00000093342 1304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm13474-201ENSMUST00000122466 815 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 4930526A20Rik-201ENSMUST00000134228 941 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Fgf8-201ENSMUST00000026240 1117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Mrps33-201ENSMUST00000031978 1107 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 0610009B22Rik-201ENSMUST00000007921 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Cacul1-202ENSMUST00000111460 5561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 A130051J06Rik-201ENSMUST00000180649 2618 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Tesk1-201ENSMUST00000060864 3947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Adra2a-201ENSMUST00000036700 3801 ntAPPRIS P1 BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Hdgfl3-202ENSMUST00000107305 5887 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Pigw-202ENSMUST00000108080 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Anks6-202ENSMUST00000107747 3980 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Dap3-201ENSMUST00000090938 4760 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ccl27a-219ENSMUST00000173865 657 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm3272-201ENSMUST00000181181 1229 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Uchl3-201ENSMUST00000002289 903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Gm10566-201ENSMUST00000086739 996 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Cacfd1-205ENSMUST00000114007 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Ext2-212ENSMUST00000184931 2629 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Plppr2-201ENSMUST00000046371 2626 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 4930405A21Rik-202ENSMUST00000139042 994 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Lamtor5-201ENSMUST00000145735 881 ntTSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Hmgb3-202ENSMUST00000072699 1571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.65■■□□□ 1.06
Vamp4O70480 4833418N02Rik-202ENSMUST00000146560 1495 ntTSL 1 (best) BASIC21.64■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31.1 ms