Protein–RNA interactions for Protein: O70373

Xirp1, Xin actin-binding repeat-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 1,129 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Xirp1O70373 Mbip-201ENSMUST00000021416 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Polr3e-203ENSMUST00000207481 2545 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Rnf128-201ENSMUST00000113026 2750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Lrch3-211ENSMUST00000170899 2752 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Tedc2-201ENSMUST00000024930 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Coq8b-202ENSMUST00000108378 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Bex3-202ENSMUST00000113112 826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm20635-201ENSMUST00000176473 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Cdc14b-201ENSMUST00000039318 5859 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Xirp1O70373 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Dhrs7-201ENSMUST00000021512 1385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Clstn2-201ENSMUST00000035027 4365 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Tra2a-204ENSMUST00000204189 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 9530080O11Rik-201ENSMUST00000137239 1475 ntTSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Mettl4-ps1-202ENSMUST00000130218 1323 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Snx25-203ENSMUST00000110378 3445 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gm11841-201ENSMUST00000117060 1963 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Tfap2a-209ENSMUST00000225180 1828 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Crct1-202ENSMUST00000107301 460 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gm12527-201ENSMUST00000117967 564 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Tnfaip8l2-201ENSMUST00000013851 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 AC167978.1-201ENSMUST00000182488 456 ntTSL 3 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Arhgef17-204ENSMUST00000209041 4516 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Cct8-201ENSMUST00000026704 2394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Mturn-203ENSMUST00000190641 5303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Cdc42ep3-201ENSMUST00000068958 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Marveld1-201ENSMUST00000061111 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Sdsl-201ENSMUST00000031594 1476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Runx1t1-201ENSMUST00000006761 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Tlcd1-204ENSMUST00000127587 1412 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Mmp28-204ENSMUST00000119346 1517 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gpr180-201ENSMUST00000022728 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ube2k-201ENSMUST00000142407 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 3110082J24Rik-201ENSMUST00000127749 327 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gm34933-201ENSMUST00000203245 1067 ntTSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Rpl18a-206ENSMUST00000212709 700 ntTSL 2 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ptpre-201ENSMUST00000073961 5410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Zmynd15-203ENSMUST00000108563 2649 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Rhot2-201ENSMUST00000043897 3189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Abi1-215ENSMUST00000178908 2239 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Fignl2-201ENSMUST00000178140 4206 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Msi2-201ENSMUST00000092794 1855 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gbx1-201ENSMUST00000088311 3475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gm5421-201ENSMUST00000181698 2354 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Fam131b-201ENSMUST00000031891 4065 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Itgb7-201ENSMUST00000001327 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 F830208F22Rik-202ENSMUST00000143732 2891 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Sbf1-201ENSMUST00000123791 6190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Pigp-203ENSMUST00000113910 966 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Spr-202ENSMUST00000174286 775 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gm37856-201ENSMUST00000191634 999 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Tm7sf2-202ENSMUST00000113543 1498 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ube2d3-202ENSMUST00000166033 2504 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Cct6b-201ENSMUST00000021040 1787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Yipf2-204ENSMUST00000213809 1883 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ap2a2-201ENSMUST00000003038 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Dbndd1-202ENSMUST00000176286 1344 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ldb1-205ENSMUST00000137771 2014 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Rhof-201ENSMUST00000031401 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Nudt4-201ENSMUST00000020217 3210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Il6st-208ENSMUST00000184311 2985 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ctsf-201ENSMUST00000119694 1975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Zkscan14-201ENSMUST00000031632 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Plxdc1-202ENSMUST00000107564 619 ntTSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Snrnp35-202ENSMUST00000111453 1181 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ccdc58-202ENSMUST00000163352 970 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ccdc58-203ENSMUST00000164916 1096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Cul4a-201ENSMUST00000016680 3728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Cadm3-201ENSMUST00000005470 2518 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Pmepa1-201ENSMUST00000036248 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Phtf1-201ENSMUST00000055425 3060 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gm26526-201ENSMUST00000181075 2927 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gm11620-201ENSMUST00000118770 1845 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Sema6c-214ENSMUST00000202315 2843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Gabarapl1-202ENSMUST00000204487 902 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Kcnn4-203ENSMUST00000205626 461 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 4833428L15Rik-202ENSMUST00000215652 641 ntTSL 3 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ostf1-201ENSMUST00000025631 2726 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Rbpj-203ENSMUST00000113865 5440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Dvl3-204ENSMUST00000171774 2319 ntTSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Acads-201ENSMUST00000031524 1870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Xirp1O70373 Smurf2-201ENSMUST00000092517 3125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms