Protein–RNA interactions for Protein: O70370

Ctss, Cathepsin S, mousemouse

Predictions only

Length 340 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CtssO70370 Lrriq4-203ENSMUST00000172350 1797 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm27000-201ENSMUST00000182943 842 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Epn1-207ENSMUST00000208634 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Krt10-202ENSMUST00000211768 557 ntTSL 3 BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Gm18669-201ENSMUST00000216049 778 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Pomp-201ENSMUST00000031654 1579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Etfb-201ENSMUST00000004729 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Plpbp-202ENSMUST00000098851 1368 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
CtssO70370 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 Dlg3-204ENSMUST00000113736 4940 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rsu1-201ENSMUST00000028059 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 Rdx-202ENSMUST00000061352 1502 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
CtssO70370 Tbcb-201ENSMUST00000006254 1416 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Ssc4d-203ENSMUST00000111152 2745 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Magix-201ENSMUST00000115695 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Dpy30-201ENSMUST00000112571 790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm27357-201ENSMUST00000183754 135 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Odf3b-201ENSMUST00000049968 1040 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Nfkbib-201ENSMUST00000032815 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
CtssO70370 Zfp804a-201ENSMUST00000047527 4620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Pdgfa-203ENSMUST00000110896 1363 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm14029-201ENSMUST00000151051 1348 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Lrrc57-204ENSMUST00000102499 1961 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm16712-201ENSMUST00000181962 1960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Podxl2-201ENSMUST00000038409 1994 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Psme2-208ENSMUST00000161807 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm28033-201ENSMUST00000184224 96 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm27742-201ENSMUST00000184667 60 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 4933412L11Rik-201ENSMUST00000203702 1044 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Hist1h2af-201ENSMUST00000073261 399 ntAPPRIS P1 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Prima1-201ENSMUST00000074416 909 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Ncoa5-203ENSMUST00000122070 3117 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
CtssO70370 Notch4-201ENSMUST00000015612 6591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Abcd4-210ENSMUST00000223107 2410 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Antxr1-201ENSMUST00000042025 5253 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Rerg-204ENSMUST00000149100 635 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm17971-201ENSMUST00000190239 806 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Ighv6-1-201ENSMUST00000193612 343 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Upk3a-201ENSMUST00000023070 1106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Med29-201ENSMUST00000003536 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Cmip-202ENSMUST00000166750 2408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Pfn2-201ENSMUST00000066882 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm38534-201ENSMUST00000206566 1909 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Tarbp1-201ENSMUST00000170518 6383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm5828-201ENSMUST00000071842 1860 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
CtssO70370 P2ry2-204ENSMUST00000207916 2372 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Mmd-202ENSMUST00000107887 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Cxxc1-201ENSMUST00000025444 2618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Hsf4-202ENSMUST00000163734 1630 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Rps27a-202ENSMUST00000102845 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm20422-202ENSMUST00000149782 956 ntTSL 2 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm15890-201ENSMUST00000161024 770 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 AC156576.2-201ENSMUST00000222752 503 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Otx2os1-206ENSMUST00000228153 787 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gmnn-201ENSMUST00000006898 1127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Hist1h2ai-201ENSMUST00000070124 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Hist1h2an-201ENSMUST00000091751 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Rtkn-201ENSMUST00000065512 2191 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Atf4-201ENSMUST00000109605 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Pcnp-202ENSMUST00000114444 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
CtssO70370 Tyk2-205ENSMUST00000214864 1662 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Shc2-201ENSMUST00000020564 3243 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Rnf169-201ENSMUST00000080817 7147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Mfsd4a-203ENSMUST00000112370 2565 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm14464-201ENSMUST00000119658 1254 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Taco1os-201ENSMUST00000140736 644 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Mir3081-201ENSMUST00000175305 84 ntBASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Rbm4-203ENSMUST00000178615 1018 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm26620-201ENSMUST00000180542 817 ntAPPRIS P1 BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Bnip2-203ENSMUST00000117450 1465 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gm26627-201ENSMUST00000181540 1487 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Slk-201ENSMUST00000026043 7278 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Fnbp1-205ENSMUST00000113552 1910 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Gtf2h4-201ENSMUST00000001565 1679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
CtssO70370 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
CtssO70370 C1ql3-201ENSMUST00000061545 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 19.8 ms