Protein–RNA interactions for Protein: O70340

Nptx2, Neuronal pentraxin-2, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nptx2O70340 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Pdxdc1-203ENSMUST00000115803 1268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Syt8-205ENSMUST00000122393 1291 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Pigf-201ENSMUST00000024957 988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Prok1-201ENSMUST00000049852 813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Coa6-201ENSMUST00000059093 747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Irf3-213ENSMUST00000209066 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ccdc17-201ENSMUST00000051869 2003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ache-201ENSMUST00000024099 2186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Raver2-201ENSMUST00000038463 4045 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Zfp697-202ENSMUST00000178372 4703 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.62■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Clcn2-202ENSMUST00000120099 2812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Rbpms-213ENSMUST00000191473 2547 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ern1-204ENSMUST00000106801 1957 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Trim44-201ENSMUST00000102573 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Gm16759-201ENSMUST00000126238 1393 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Izumo1r-204ENSMUST00000121116 726 ntTSL 2 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ptf1aos-201ENSMUST00000122978 916 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Gm14453-201ENSMUST00000139677 553 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Gm3764-209ENSMUST00000181550 1093 ntTSL 3 BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Gm2274-201ENSMUST00000184539 609 ntBASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Cmc1-202ENSMUST00000215799 531 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ero1l-201ENSMUST00000022378 4418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Rtn4-204ENSMUST00000102842 2257 ntTSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 F12-201ENSMUST00000021948 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.61■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Atp2c1-204ENSMUST00000112558 5642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Skap1-203ENSMUST00000100521 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Skap1-204ENSMUST00000103154 1507 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ptges3l-202ENSMUST00000103102 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 1810062O18Rik-202ENSMUST00000128848 745 ntTSL 3 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Gm32151-201ENSMUST00000223521 915 ntTSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Mrpl21-201ENSMUST00000025743 802 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Abhd13-201ENSMUST00000048216 5074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Mink1-201ENSMUST00000072237 4994 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 1600012H06Rik-201ENSMUST00000052691 2506 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Cdk10-201ENSMUST00000036880 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.6■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Wnt10b-207ENSMUST00000228594 1510 ntAPPRIS P1 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ahcyl2-202ENSMUST00000102995 5155 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Atf7-209ENSMUST00000184485 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Vrk2-201ENSMUST00000078362 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Muc2-203ENSMUST00000179227 399 ntTSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Pdxk-ps-203ENSMUST00000183934 680 ntTSL 3 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Cacul1-201ENSMUST00000081790 5790 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Sart1-201ENSMUST00000044207 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Sim1-202ENSMUST00000219436 1687 ntTSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Dtnbp1-203ENSMUST00000220555 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.59■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Tdh-201ENSMUST00000022522 1881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Magi3-203ENSMUST00000122303 3827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Mafg-201ENSMUST00000058162 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Dusp12-201ENSMUST00000027970 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ccnd3-202ENSMUST00000171031 2113 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Tigd3-201ENSMUST00000055911 2114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.57
Nptx2O70340 Stambpl1-201ENSMUST00000054956 2024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Prdx5-201ENSMUST00000025904 1262 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Nadk2-202ENSMUST00000100789 3578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Mycbp-202ENSMUST00000106202 1536 ntTSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Nrl-201ENSMUST00000062232 2504 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Il17re-208ENSMUST00000204774 2146 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.58■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Tspan9-201ENSMUST00000032503 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Nxnl1-201ENSMUST00000048243 2285 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Slc39a10-201ENSMUST00000027131 5498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Asap2-204ENSMUST00000101562 5552 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 2210408F21Rik-208ENSMUST00000144612 450 ntTSL 3 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Gm26709-202ENSMUST00000223049 819 ntTSL 5 BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Atp2c1-201ENSMUST00000038118 4876 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Adat2-201ENSMUST00000019944 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.57■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Soga1-201ENSMUST00000069098 7864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Ffar3-201ENSMUST00000094583 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 5031425F14Rik-201ENSMUST00000127920 2098 ntTSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Nptx2O70340 Proser2-201ENSMUST00000054254 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.56■□□□□ 0.56
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 86.2 ms