Protein–RNA interactions for Protein: O70309

Itgb5, Integrin beta-5, mousemouse

Predictions only

Length 798 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Itgb5O70309 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm11355-201ENSMUST00000121120 306 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Gm10459-201ENSMUST00000202708 1155 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Spata33-206ENSMUST00000212637 569 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Nudt1-201ENSMUST00000050205 954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Nudt1-202ENSMUST00000071881 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Lce1i-201ENSMUST00000090866 731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Arhgef9-208ENSMUST00000128565 2285 ntTSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Dtx4-201ENSMUST00000045521 5765 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 March3-202ENSMUST00000102912 1754 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Rbm15b-201ENSMUST00000055843 6511 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ttc39a-201ENSMUST00000064129 2356 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Pafah1b1-201ENSMUST00000021091 5803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Ptgis-202ENSMUST00000088041 1711 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Proca1-203ENSMUST00000108317 1359 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Snx16-202ENSMUST00000099223 2512 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Itgb5O70309 Tekt5-202ENSMUST00000115831 1277 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Mir142hg-201ENSMUST00000123700 269 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm9013-201ENSMUST00000132939 882 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fcho2-208ENSMUST00000224992 2964 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Nthl1-201ENSMUST00000047611 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 4933427E11Rik-201ENSMUST00000056711 1214 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gfra4-202ENSMUST00000066958 783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Olfr1232-201ENSMUST00000099785 936 ntAPPRIS P1 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm10819-201ENSMUST00000099988 561 ntBASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ciz1-205ENSMUST00000113338 2666 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Il9r-204ENSMUST00000142396 1542 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Mfsd10-202ENSMUST00000114329 1906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Dtnb-222ENSMUST00000174479 3689 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Mprip-203ENSMUST00000108751 4021 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Dap-201ENSMUST00000044524 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Clasp2-204ENSMUST00000213663 2727 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Foxj2-201ENSMUST00000003238 5283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Arid3b-202ENSMUST00000098686 1969 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm13025-201ENSMUST00000141469 1163 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ndufab1-ps-201ENSMUST00000166096 468 ntBASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm10358-201ENSMUST00000212864 1250 ntAPPRIS P1 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Nme3-201ENSMUST00000024978 715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ptpra-201ENSMUST00000028769 3227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Slc16a3-201ENSMUST00000070653 2272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Arfip2-202ENSMUST00000084782 2254 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Amigo2-201ENSMUST00000053106 2871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Farsa-202ENSMUST00000109754 1795 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Hmbox1-203ENSMUST00000175744 1771 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Nus1-201ENSMUST00000023830 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm26592-201ENSMUST00000180870 1730 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Hdhd2-202ENSMUST00000097521 1716 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Sars2-201ENSMUST00000094632 1868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Lmbrd1-202ENSMUST00000186096 688 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm28793-201ENSMUST00000190845 413 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 AC130711.1-201ENSMUST00000224277 906 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Tmem35b-201ENSMUST00000094712 1120 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 C530025M09Rik-201ENSMUST00000099264 690 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Acvr2b-205ENSMUST00000215746 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ciz1-201ENSMUST00000048964 2771 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fam131c-201ENSMUST00000006380 1433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Trim68-201ENSMUST00000082175 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gpd1l-201ENSMUST00000084853 1436 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Dcaf8-206ENSMUST00000192704 2859 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Pou2f2-202ENSMUST00000108413 1599 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Asap2-203ENSMUST00000090834 5097 ntTSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Vps53-203ENSMUST00000108419 2209 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Zbtb25-201ENSMUST00000167011 1681 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm43182-201ENSMUST00000199476 2528 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Ptpa-202ENSMUST00000113601 1838 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 2810408A11Rik-204ENSMUST00000108621 1455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Surf1-201ENSMUST00000015934 1173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Pard3-219ENSMUST00000162309 5659 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Por-201ENSMUST00000005651 2636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Atad3a-201ENSMUST00000030903 2413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Zdhhc6-209ENSMUST00000225495 1711 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Hmg20b-204ENSMUST00000122993 1502 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Rusc2-201ENSMUST00000035645 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Usp21-202ENSMUST00000111305 2278 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Agfg2-202ENSMUST00000100544 2858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Chst1-201ENSMUST00000065797 2680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gpat3-203ENSMUST00000112887 3059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Etnk1-204ENSMUST00000205256 2647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Thumpd3-201ENSMUST00000032398 2163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Itgb5O70309 Snrpd2-201ENSMUST00000049294 1420 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 31 ms