Protein–RNA interactions for Protein: O70263

Lnx1, E3 ubiquitin-protein ligase LNX, mousemouse

Predictions only

Length 728 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lnx1O70263 Tgds-201ENSMUST00000022727 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Sema3c-201ENSMUST00000030568 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Hmces-201ENSMUST00000032141 1464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 A130014A01Rik-201ENSMUST00000183021 2323 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Gm7889-201ENSMUST00000185591 958 ntBASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ssr2-207ENSMUST00000195014 1059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.01■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Agpat3-203ENSMUST00000105388 3681 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Krt6a-201ENSMUST00000023788 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Larp1b-206ENSMUST00000191872 1505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Nptxr-201ENSMUST00000023057 5004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Nelfb-201ENSMUST00000059849 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Foxp4-204ENSMUST00000113265 3999 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Asph-204ENSMUST00000084915 2884 ntTSL 5 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Taf6l-205ENSMUST00000176496 2224 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Mlxip-202ENSMUST00000111596 2653 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Sept4-205ENSMUST00000107962 1678 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Baiap2-204ENSMUST00000106231 4005 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Trmo-202ENSMUST00000086563 1554 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Gse1-202ENSMUST00000118136 4492 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Hilpda-202ENSMUST00000115289 658 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Ankrd39-202ENSMUST00000194894 664 ntTSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Fxyd1-208ENSMUST00000205807 539 ntTSL 3 BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Nos1ap-207ENSMUST00000161966 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Prdm11-201ENSMUST00000111272 3012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Bean1-204ENSMUST00000171018 3386 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Gm45244-201ENSMUST00000211328 2200 ntBASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Snapc3-201ENSMUST00000030206 1405 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Naf1-201ENSMUST00000118009 2990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Proc-201ENSMUST00000171765 1566 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Rala-201ENSMUST00000009003 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ints8-202ENSMUST00000108318 3169 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Aurkb-201ENSMUST00000021277 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Gjb3-201ENSMUST00000046532 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Mrpl39-201ENSMUST00000116584 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Rap2a-201ENSMUST00000062117 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Mmd-201ENSMUST00000004050 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Tpsg1-201ENSMUST00000024999 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ppic-201ENSMUST00000025419 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Lysmd2-201ENSMUST00000034702 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Tasp1-201ENSMUST00000046656 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 AW011738-201ENSMUST00000105140 1848 ntAPPRIS P1 BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Lrch3-201ENSMUST00000023491 5536 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Trappc3-201ENSMUST00000030660 1336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Slc35e3-201ENSMUST00000079041 3489 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 A430078I02Rik-202ENSMUST00000154066 2233 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Zranb2-203ENSMUST00000106058 2924 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Slc7a5-201ENSMUST00000045557 3517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Pthlh-202ENSMUST00000204197 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Cdk2ap2-201ENSMUST00000025779 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ntpcr-201ENSMUST00000034313 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Sh3gl2-203ENSMUST00000107188 2286 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ccdc105-201ENSMUST00000105383 1714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Ntng1-207ENSMUST00000131027 1485 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Rprd1b-207ENSMUST00000152452 1910 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Ubtf-207ENSMUST00000128016 1062 ntTSL 2 BASIC19.97■□□□□ 0.79
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Lnx1O70263 Arl2-201ENSMUST00000025893 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Fgfr2-211ENSMUST00000120187 4311 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ppm1h-201ENSMUST00000067918 6369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 C230012O17Rik-201ENSMUST00000130085 2999 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Trim67-201ENSMUST00000041106 5694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 D730003I15Rik-202ENSMUST00000194375 1667 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Nsmf-203ENSMUST00000100334 2957 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Slc47a1-201ENSMUST00000010267 2639 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Aspscr1-205ENSMUST00000106160 1550 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Ddhd2-206ENSMUST00000211688 2265 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Zscan25-201ENSMUST00000094116 1796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 E030042O20Rik-201ENSMUST00000135244 1427 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Cacng6-202ENSMUST00000183200 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Bcl9l-206ENSMUST00000220303 5760 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Rfesd-202ENSMUST00000167271 595 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 4930579K19Rik-202ENSMUST00000190541 632 ntTSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Gm10517-202ENSMUST00000192970 758 ntBASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Cenps-201ENSMUST00000030813 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Nrbp1-207ENSMUST00000202576 2221 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
Lnx1O70263 Nrbp1-201ENSMUST00000031034 2203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
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