Protein–RNA interactions for Protein: O55234

Psmb5, Proteasome subunit beta type-5, mousemouse

Predictions only

Length 264 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Psmb5O55234 Med9-201ENSMUST00000081980 1920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Il17rb-202ENSMUST00000122205 2094 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm20878-202ENSMUST00000108028 339 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fez2-202ENSMUST00000112487 2020 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Tfg-202ENSMUST00000121554 716 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fiz1-203ENSMUST00000167804 2637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ddah2-204ENSMUST00000174493 1254 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm19426-201ENSMUST00000181711 726 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm43353-201ENSMUST00000199224 1295 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm9731-201ENSMUST00000209480 747 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Lrrc47-201ENSMUST00000030894 3395 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Il1rn-201ENSMUST00000114482 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Prob1-203ENSMUST00000190196 4888 ntAPPRIS P1 BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Tcf7l2-203ENSMUST00000111646 2839 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 4933428P19Rik-201ENSMUST00000199616 1376 ntBASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fndc11-201ENSMUST00000050026 1387 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Rasl10b-204ENSMUST00000175848 3249 ntTSL 1 (best) BASIC16.49■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fam57b-201ENSMUST00000079423 2328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fam166b-201ENSMUST00000052829 1349 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ntrk1-201ENSMUST00000029712 2588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Polr3h-201ENSMUST00000023113 2514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Sept10-203ENSMUST00000220156 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm13559-201ENSMUST00000120476 863 ntBASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Nrn1-202ENSMUST00000122286 691 ntTSL 3 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Snrnp48-202ENSMUST00000178564 847 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm35240-201ENSMUST00000218335 661 ntTSL 2 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 H2afz-201ENSMUST00000041045 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Lsm10-201ENSMUST00000055575 943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ripply2-201ENSMUST00000058846 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Bmp8a-201ENSMUST00000040496 2405 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 2810408A11Rik-203ENSMUST00000102580 1640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Arhgef25-212ENSMUST00000222006 1896 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ubr5-201ENSMUST00000110336 9242 ntTSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Dbn1-202ENSMUST00000109921 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Krt15-201ENSMUST00000107411 1700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.48■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Smim3-201ENSMUST00000042710 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Pdxdc1-202ENSMUST00000115802 2466 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Zxdc-203ENSMUST00000113539 4864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Mpst-203ENSMUST00000169133 1309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Krt13-201ENSMUST00000007275 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Agbl4-205ENSMUST00000106591 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ank1-207ENSMUST00000118733 8201 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Prss54-205ENSMUST00000213096 1501 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Steap1-201ENSMUST00000015796 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm17661-201ENSMUST00000170317 270 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm4217-201ENSMUST00000182243 1002 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm26938-201ENSMUST00000182839 744 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm27463-201ENSMUST00000183569 57 ntBASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm45618-201ENSMUST00000209890 660 ntAPPRIS P1 BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ndor1-202ENSMUST00000114349 2336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Mmp28-201ENSMUST00000021020 2311 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Atp5c1-202ENSMUST00000114896 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Slc5a10-201ENSMUST00000051552 2261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fam46c-201ENSMUST00000061455 5640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Btnl9-201ENSMUST00000046522 5273 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.47■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gprin1-202ENSMUST00000135343 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Tmem175-204ENSMUST00000146207 1686 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Mpdu1-201ENSMUST00000018905 1321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fgf4-201ENSMUST00000060336 3030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fam110a-204ENSMUST00000109865 1853 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Trim37-201ENSMUST00000041282 5632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ntn1-201ENSMUST00000021284 5738 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Mag-201ENSMUST00000040548 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Sharpin-201ENSMUST00000023211 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Pdcd5-202ENSMUST00000120714 767 ntTSL 3 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gm20403-201ENSMUST00000173803 372 ntAPPRIS P1 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Fitm1-201ENSMUST00000022826 971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Sec11c-201ENSMUST00000025394 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Gng11-201ENSMUST00000031670 919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Limd2-202ENSMUST00000064545 798 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Garem1-201ENSMUST00000049260 4923 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Plac9a-201ENSMUST00000052286 1555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.23
Psmb5O55234 Ppfia1-201ENSMUST00000168134 5181 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Nsmf-202ENSMUST00000074422 2824 ntTSL 1 (best) BASIC16.46■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Mmp23-201ENSMUST00000030937 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Hoxb4-201ENSMUST00000049241 2566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Efnb2-201ENSMUST00000001319 4793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Pacsin1-203ENSMUST00000114872 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Gm16861-201ENSMUST00000181498 1647 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Arhgef16-201ENSMUST00000030898 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Kdelr2-201ENSMUST00000110731 1829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 4833413E03Rik-201ENSMUST00000013706 1091 ntTSL 5 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Psmb5O55234 Gm14114-201ENSMUST00000139345 287 ntTSL 3 BASIC16.45■□□□□ 0.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms