Protein–RNA interactions for Protein: O55229

Chkb, Choline/ethanolamine kinase, mousemouse

Predictions only

Length 394 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChkbO55229 Myo9b-206ENSMUST00000212935 6316 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Bcor-202ENSMUST00000065143 6839 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gsk3b-201ENSMUST00000023507 8303 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Serinc2-201ENSMUST00000105996 1878 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Pld2-203ENSMUST00000108557 3655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Sgsm1-204ENSMUST00000112325 2274 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm15743-202ENSMUST00000182690 1901 ntBASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Kcnab3-201ENSMUST00000018614 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Taf9-205ENSMUST00000190594 1962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Anapc16-201ENSMUST00000020307 1379 ntTSL 2 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Nup85-201ENSMUST00000021085 2230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gpr20-201ENSMUST00000064166 2144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 1700028I16Rik-201ENSMUST00000076984 1048 ntTSL 5 BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Kcmf1-201ENSMUST00000068697 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Plppr2-203ENSMUST00000190387 2608 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.36■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Naa60-212ENSMUST00000186375 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gas2-201ENSMUST00000051912 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Adsl-204ENSMUST00000164806 1595 ntTSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Kank3-202ENSMUST00000172649 2652 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 5730522E02Rik-201ENSMUST00000109511 1162 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Arl2bp-202ENSMUST00000109527 1133 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Josd2-204ENSMUST00000118628 864 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Dsg2-203ENSMUST00000121837 953 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm27011-201ENSMUST00000182352 972 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Josd2-201ENSMUST00000035844 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Ptprd-206ENSMUST00000107289 9899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Acvr2a-201ENSMUST00000063886 5686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rexo1-201ENSMUST00000057910 5250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm26548-201ENSMUST00000181165 2029 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Dync1li2-201ENSMUST00000041769 4627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Tpra1-223ENSMUST00000204765 1738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Fmnl3-203ENSMUST00000120633 4290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Map3k7-201ENSMUST00000037607 5773 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rap1gap-202ENSMUST00000097837 3168 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Kcnq2-201ENSMUST00000016491 3067 ntTSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Acap3-201ENSMUST00000079031 4301 ntTSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Ppfibp1-201ENSMUST00000016631 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Metrn-202ENSMUST00000165838 1363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rtcb-201ENSMUST00000001834 2009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Gm17041-201ENSMUST00000163196 479 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Theg-202ENSMUST00000077433 1275 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Lrrtm1-202ENSMUST00000159616 2541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Slc44a1-201ENSMUST00000102911 3102 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Irgc1-204ENSMUST00000205776 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Slc27a1-207ENSMUST00000212889 2730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Zfp691-202ENSMUST00000106355 1588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Chka-202ENSMUST00000072055 2549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Acap3-202ENSMUST00000105584 4365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Aire-204ENSMUST00000128241 1938 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Aire-205ENSMUST00000130972 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Aire-212ENSMUST00000145975 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Aire-201ENSMUST00000019257 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Igsf23-201ENSMUST00000043440 1908 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Dleu2-208ENSMUST00000182768 1442 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Lsp1-204ENSMUST00000105967 1395 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Pitx3-201ENSMUST00000026259 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Zdhhc16-201ENSMUST00000026154 1821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 P2ry1-203ENSMUST00000193943 2203 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Fam57b-207ENSMUST00000207020 1777 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
ChkbO55229 Zufsp-202ENSMUST00000218055 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Aunip-201ENSMUST00000105866 1275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm15648-201ENSMUST00000149681 778 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Timp4-202ENSMUST00000205131 945 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Prmt1-205ENSMUST00000207659 945 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Prmt1-201ENSMUST00000045325 1071 ntTSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Vgll2-201ENSMUST00000058347 966 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Pcmt1-202ENSMUST00000159917 2491 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 B3galnt2-204ENSMUST00000221300 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Rab11fip3-202ENSMUST00000120691 5103 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Itgb1bp1-201ENSMUST00000076260 1874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Inpp5f-201ENSMUST00000043138 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tm9sf1-205ENSMUST00000122358 2517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Nfe2l3-201ENSMUST00000005103 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Epha10-201ENSMUST00000059343 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Snx27-202ENSMUST00000107283 3531 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Mycl-201ENSMUST00000030407 3501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Zfc3h1-201ENSMUST00000036044 6957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 E230001N04Rik-202ENSMUST00000181029 2091 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Slc23a4-205ENSMUST00000201355 2003 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Bmp2k-201ENSMUST00000035635 7387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Stam-202ENSMUST00000102960 5000 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Tpd52-205ENSMUST00000120143 6317 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ttbk1-201ENSMUST00000047034 6959 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Zbtb22-201ENSMUST00000053429 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm20628-201ENSMUST00000177363 3215 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Rasip1-201ENSMUST00000057927 3202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Fam120c-201ENSMUST00000073364 5463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gnaz-201ENSMUST00000037813 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Ppp1r8-202ENSMUST00000105919 1090 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Vkorc1-202ENSMUST00000119922 387 ntTSL 3 BASIC18.32■□□□□ 0.52
ChkbO55229 Gm13441-201ENSMUST00000140104 1168 ntTSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27 ms