Protein–RNA interactions for Protein: O55143

Atp2a2, Sarcoplasmic/endoplasmic reticulum calcium ATPase 2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,044 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Atp2a2O55143 Pon1-201ENSMUST00000002663 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mff-208ENSMUST00000160786 1645 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ddx28-201ENSMUST00000058579 2262 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 8030462N17Rik-201ENSMUST00000074653 3418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ino80e-201ENSMUST00000050833 1944 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Crebl2-201ENSMUST00000046303 3629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mir1199-201ENSMUST00000117015 119 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cxxc4-201ENSMUST00000166288 1290 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm20695-202ENSMUST00000176233 1012 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm10138-203ENSMUST00000206952 366 ntBASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Bmyc-201ENSMUST00000061483 983 ntAPPRIS P1 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Hnrnph3-201ENSMUST00000020263 2213 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 AL591207.1-203ENSMUST00000222401 1380 ntTSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Nanp-201ENSMUST00000066640 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cenpa-205ENSMUST00000144742 1466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Dnaja3-202ENSMUST00000115854 2505 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Dpf1-202ENSMUST00000065181 1574 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Vps37a-201ENSMUST00000098817 6379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Zbtb32-202ENSMUST00000108151 1775 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Phb-204ENSMUST00000125172 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cnpy1-202ENSMUST00000118882 1984 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Pigl-201ENSMUST00000014389 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Rrbp1-201ENSMUST00000016072 5177 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Commd7-202ENSMUST00000109782 1343 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tmem229a-201ENSMUST00000127247 5157 ntAPPRIS P1 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Rab5c-202ENSMUST00000107364 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Coil-201ENSMUST00000036649 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tle2-213ENSMUST00000146358 2749 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Dusp9-201ENSMUST00000019701 2722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Krt80-201ENSMUST00000077196 1774 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm16127-201ENSMUST00000131619 234 ntTSL 5 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Zfp787-204ENSMUST00000207628 576 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Kmt5b-203ENSMUST00000113968 3216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Dscr3-201ENSMUST00000023615 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Nfil3-201ENSMUST00000071065 2026 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ripor2-205ENSMUST00000110384 5608 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ociad2-202ENSMUST00000200776 2359 ntTSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Slc30a10-201ENSMUST00000061093 5836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Fxyd6-203ENSMUST00000217381 1789 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ankrd22-201ENSMUST00000025686 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Thsd7a-202ENSMUST00000119581 5678 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ryr2-203ENSMUST00000220597 4924 ntTSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Puf60-201ENSMUST00000002599 1821 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mtx1-201ENSMUST00000073572 1617 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cnksr2-201ENSMUST00000026750 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Dag1-201ENSMUST00000080435 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Crebzf-201ENSMUST00000061767 3376 ntAPPRIS P1 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tmed3-201ENSMUST00000058488 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Fam98a-201ENSMUST00000112507 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.22■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Lpin2-213ENSMUST00000156570 1586 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Lmbr1-207ENSMUST00000200564 1598 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Clip2-202ENSMUST00000100647 4994 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mycn-202ENSMUST00000130990 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Tmem57-201ENSMUST00000030628 3826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Pex5-202ENSMUST00000080557 3073 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Rhno1-202ENSMUST00000112151 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Arfip2-212ENSMUST00000209550 1141 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Arfip2-214ENSMUST00000210911 938 ntTSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Mrps12-201ENSMUST00000056078 722 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Gm7579-201ENSMUST00000097943 732 ntAPPRIS P1 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Zdhhc6-201ENSMUST00000076891 2263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Cep68-204ENSMUST00000162811 2788 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Atp5d-203ENSMUST00000105367 1410 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 4930426D05Rik-202ENSMUST00000139804 1650 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Isca1-201ENSMUST00000057115 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ocel1-202ENSMUST00000110051 2179 ntTSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Ecel1-201ENSMUST00000027463 2695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Wnt4-201ENSMUST00000045747 4194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Rab1a-201ENSMUST00000020358 2827 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Guca1b-202ENSMUST00000145462 1556 ntTSL 2 BASIC18.21■□□□□ 0.51
Atp2a2O55143 Dusp4-201ENSMUST00000033930 2740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Urgcp-206ENSMUST00000170116 5528 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Apaf1-202ENSMUST00000159110 6433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.21■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Dhh-201ENSMUST00000023737 2363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tmem51os1-202ENSMUST00000141769 2131 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Rai1-201ENSMUST00000064190 7348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Haus8-201ENSMUST00000035960 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Sox4-201ENSMUST00000067230 4795 ntAPPRIS P1 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Ifrd2-201ENSMUST00000010192 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm15375-201ENSMUST00000119510 849 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm16998-201ENSMUST00000181899 1230 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm37194-201ENSMUST00000193092 3031 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Uso1-204ENSMUST00000202155 3707 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Tekt1-201ENSMUST00000021155 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Btbd6-202ENSMUST00000165079 1975 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Dnaaf5-203ENSMUST00000196441 2426 ntTSL 1 (best) BASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm45560-201ENSMUST00000211492 1472 ntBASIC18.2■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Atp2b2-201ENSMUST00000089003 7067 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm19554-201ENSMUST00000220934 2076 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Odf2-211ENSMUST00000113767 2249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Bend6-202ENSMUST00000115161 2231 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Cisd2-202ENSMUST00000120988 1363 ntTSL 1 (best) BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Smim10l1-204ENSMUST00000191462 574 ntTSL 3 BASIC18.19■□□□□ 0.5
Atp2a2O55143 Gm37055-201ENSMUST00000191866 133 ntBASIC18.19■□□□□ 0.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.2 ms