Protein–RNA interactions for Protein: O55111

Dsg2, Desmoglein-2, mousemouse

Predictions only

Length 1,122 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Dsg2O55111 Tnfrsf25-201ENSMUST00000025706 1661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Hnrnph3-203ENSMUST00000119814 682 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Ramp2-204ENSMUST00000129680 1178 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Pagr1a-203ENSMUST00000206416 558 ntTSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Gm44973-201ENSMUST00000207050 1003 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Mgst3-201ENSMUST00000028005 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 C1qbp-201ENSMUST00000078528 1175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Dsg2O55111 Isyna1-201ENSMUST00000019283 1836 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm4675-202ENSMUST00000164755 2322 ntTSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Trp73-203ENSMUST00000105643 1916 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Hhat-203ENSMUST00000128619 1819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Insig2-201ENSMUST00000003818 2697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Orai3-201ENSMUST00000061587 1996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Paics-201ENSMUST00000031160 2482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm9103-201ENSMUST00000119371 405 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Rpl14-201ENSMUST00000165532 1009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm29518-201ENSMUST00000190858 372 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Ndufs7-201ENSMUST00000020361 758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 A430010J10Rik-201ENSMUST00000054470 408 ntBASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Hjurp-202ENSMUST00000065420 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Lhx8-205ENSMUST00000205251 1729 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gfi1-201ENSMUST00000031205 2860 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 A530016L24Rik-202ENSMUST00000223266 1547 ntTSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Map6-202ENSMUST00000107100 2335 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Ythdc1-202ENSMUST00000119339 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Map3k1-201ENSMUST00000109267 6978 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Bhlhe22-201ENSMUST00000026120 3344 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Smim12-201ENSMUST00000142029 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Snx15-207ENSMUST00000154601 767 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 4930505N22Rik-201ENSMUST00000181820 945 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm27704-201ENSMUST00000185094 107 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Piga-208ENSMUST00000208697 947 ntTSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 1700022H01Rik-201ENSMUST00000219142 387 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Mrpl14-201ENSMUST00000024734 645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Jade1-202ENSMUST00000163764 5584 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Six3-203ENSMUST00000176081 3680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Tdrd12-201ENSMUST00000032701 1620 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 G730003C15Rik-202ENSMUST00000189096 2309 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gspt1-201ENSMUST00000080030 2898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Rnf208-202ENSMUST00000114355 1333 ntAPPRIS P1 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Map4k4-202ENSMUST00000168431 5632 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Kcnb1-201ENSMUST00000059826 4015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Renbp-202ENSMUST00000116578 1418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Hoxa10-201ENSMUST00000121043 1436 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Timm17b-201ENSMUST00000033498 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Elac2-203ENSMUST00000108697 2612 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Lats2-201ENSMUST00000022531 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm15952-201ENSMUST00000122858 490 ntTSL 3 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Ank2-226ENSMUST00000189368 339 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm17808-201ENSMUST00000200859 894 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 AC154471.1-201ENSMUST00000224418 436 ntBASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Pym1-201ENSMUST00000065210 1156 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Ly6h-202ENSMUST00000065417 985 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Mirt1-201ENSMUST00000180489 5292 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Trmo-201ENSMUST00000030015 1527 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Atp6v1g2-201ENSMUST00000068261 1528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Anapc5-203ENSMUST00000196640 2422 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Camsap3-207ENSMUST00000207712 2539 ntTSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Tm9sf2-203ENSMUST00000171318 1494 ntTSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Tmem245-202ENSMUST00000107609 2643 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Mta3-203ENSMUST00000112350 1723 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Negr1-203ENSMUST00000106065 1953 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Dscc1-201ENSMUST00000023059 1324 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Hes6-201ENSMUST00000086851 1335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Prpsap1-201ENSMUST00000106391 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Cxcl14-201ENSMUST00000021970 1827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Dmrt2-201ENSMUST00000053068 2347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Wac-207ENSMUST00000167020 5208 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Igfbpl1-201ENSMUST00000044297 2864 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Actl10-201ENSMUST00000104928 1501 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Actl10-202ENSMUST00000226583 1501 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Npb-202ENSMUST00000106194 530 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Npb-203ENSMUST00000106195 542 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Calu-207ENSMUST00000173216 673 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Flt3l-206ENSMUST00000210197 834 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm45631-201ENSMUST00000210318 1244 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Taar2-201ENSMUST00000079134 1020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Nmnat3-202ENSMUST00000112937 1898 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Nsun2-202ENSMUST00000109699 2834 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Zhx1-202ENSMUST00000110168 5212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Stxbp5-209ENSMUST00000141722 4702 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Gprc5c-203ENSMUST00000122967 1709 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 6330411D24Rik-201ENSMUST00000211105 1568 ntTSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Lrrc14-202ENSMUST00000127208 4849 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Kctd15-201ENSMUST00000032709 2480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Rac1-202ENSMUST00000100489 2325 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Fkbp5-201ENSMUST00000079413 3542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Bend4-204ENSMUST00000201972 8268 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Sap18-202ENSMUST00000111268 662 ntTSL 2 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Mrps18c-203ENSMUST00000112901 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Srgn-205ENSMUST00000162161 694 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Shc3-203ENSMUST00000223543 1241 ntTSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Rpp25l-201ENSMUST00000038434 856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Dsg2O55111 Hmgb1-202ENSMUST00000093196 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 13.9 ms