Protein–RNA interactions for Protein: O55103

Prx, Periaxin, mousemouse

Predictions only

Length 1,391 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PrxO55103 Spsb2-202ENSMUST00000052727 1219 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Hist1h2aj-201ENSMUST00000091710 352 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Prss56-201ENSMUST00000044533 2180 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ostm1-201ENSMUST00000040718 3006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm10649-203ENSMUST00000148066 1812 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Zdhhc24-201ENSMUST00000006632 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
PrxO55103 Aldh7a1-201ENSMUST00000066208 1914 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm10013-201ENSMUST00000106074 672 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Prr3-209ENSMUST00000174849 581 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm22697-201ENSMUST00000175194 63 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Bcl7c-205ENSMUST00000205977 891 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Kat2b-ps-201ENSMUST00000128468 2490 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Alyref-201ENSMUST00000026125 3527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ankra2-203ENSMUST00000123924 2328 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 3110002H16Rik-201ENSMUST00000025276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Trim14-202ENSMUST00000102924 1582 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Spi1-201ENSMUST00000002180 2034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Platr31-201ENSMUST00000180653 1466 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 9330160F10Rik-201ENSMUST00000101007 2766 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Magi2-203ENSMUST00000115267 4478 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Zpbp2-202ENSMUST00000081033 1300 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 2210016L21Rik-201ENSMUST00000031538 2607 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
PrxO55103 Arhgef19-201ENSMUST00000006618 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Arrdc4-202ENSMUST00000118110 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Mtif3-201ENSMUST00000016654 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 4930544D05Rik-204ENSMUST00000180052 755 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Gm18101-201ENSMUST00000215769 548 ntBASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Calml4-206ENSMUST00000215870 803 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Krtap1-5-201ENSMUST00000054532 1041 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Npw-201ENSMUST00000095544 638 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Disc1-208ENSMUST00000122389 1694 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Bfsp2-201ENSMUST00000124310 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Sh2b2-203ENSMUST00000196397 2797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ran-201ENSMUST00000031383 2377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Rcor1-201ENSMUST00000084968 5684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
PrxO55103 Ube2q2-201ENSMUST00000059555 3456 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrxO55103 Ppme1-201ENSMUST00000032963 2772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gm13032-201ENSMUST00000151848 2001 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrxO55103 Nagk-203ENSMUST00000113851 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrxO55103 Ppdpf-201ENSMUST00000016488 1160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrxO55103 Grtp1-204ENSMUST00000209691 1030 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
PrxO55103 Taf6l-201ENSMUST00000003777 1869 ntTSL 5 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Mroh5-201ENSMUST00000071419 2766 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Ppm1b-202ENSMUST00000112304 3262 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gm11748-201ENSMUST00000153825 1498 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gnao1-201ENSMUST00000034198 2948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Slc38a10-202ENSMUST00000053692 1947 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 A430057M04Rik-202ENSMUST00000170150 2176 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Rasd1-201ENSMUST00000062405 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Atp6v1c1-201ENSMUST00000022904 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Rapgef3os1-201ENSMUST00000149373 483 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Tcta-202ENSMUST00000192886 1094 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Irak1bp1-201ENSMUST00000034783 1159 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Cltb-201ENSMUST00000049575 1004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
PrxO55103 Nucb2-201ENSMUST00000032895 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Stim2-201ENSMUST00000117661 4934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Snx21-201ENSMUST00000056181 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Cyb561d2-201ENSMUST00000041459 1786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Tlk2-201ENSMUST00000015107 3212 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Bcap29-201ENSMUST00000020979 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Tbx2-201ENSMUST00000000095 3626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Tlcd2-202ENSMUST00000108435 1112 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Atp5l-201ENSMUST00000043675 544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Hoxa6-201ENSMUST00000062829 874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Rnf112-202ENSMUST00000060255 3161 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Col4a3bp-201ENSMUST00000077672 2746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Rpf1-201ENSMUST00000029838 1661 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
PrxO55103 Dpy19l1-203ENSMUST00000142064 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Rgmb-201ENSMUST00000170578 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Lpgat1-202ENSMUST00000110856 2792 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Slbp-203ENSMUST00000101354 1578 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Krt27-201ENSMUST00000017732 1550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Irak2-203ENSMUST00000089023 1734 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Arnt-204ENSMUST00000107160 783 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gm26827-201ENSMUST00000181911 148 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gm21559-201ENSMUST00000220638 855 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Sox6os-201ENSMUST00000032900 420 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gm8587-201ENSMUST00000076538 843 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Vps4a-201ENSMUST00000034388 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Zic1-202ENSMUST00000065360 2811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Meis2-202ENSMUST00000074285 2844 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Lman2l-202ENSMUST00000115011 2290 ntTSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 AL590614.2-201ENSMUST00000225374 1937 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
PrxO55103 Nxn-201ENSMUST00000021204 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Vav3-201ENSMUST00000046864 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Kcnk4-201ENSMUST00000025908 1715 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Nsfl1c-201ENSMUST00000028949 1364 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Fam78b-205ENSMUST00000165874 4986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Gm5577-203ENSMUST00000153372 815 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Efcab11-207ENSMUST00000223114 1122 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Iscu-201ENSMUST00000026937 957 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Vpreb1-201ENSMUST00000075017 766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Krt12-201ENSMUST00000017741 1852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
PrxO55103 Wnt10b-204ENSMUST00000226655 1807 ntBASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Dnm1-216ENSMUST00000201494 2732 ntTSL 5 BASIC23.09■■□□□ 1.29
PrxO55103 Tmem164-201ENSMUST00000087333 5149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.2 ms