Protein–RNA interactions for Protein: O55100

Syngr1, Synaptogyrin-1, mousemouse

Predictions only

Length 234 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syngr1O55100 Rxra-201ENSMUST00000077257 4905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.11■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Prkra-201ENSMUST00000002808 1614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ppm1j-201ENSMUST00000002298 1721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Crocc-211ENSMUST00000168157 6244 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Crocc-201ENSMUST00000040222 6248 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ewsr1-203ENSMUST00000079949 2588 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ube2i-207ENSMUST00000172868 2755 ntTSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Arpc4-202ENSMUST00000171058 695 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 H2-K2-201ENSMUST00000174250 1049 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 1700101I19Rik-202ENSMUST00000186712 510 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gm43183-201ENSMUST00000200632 547 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Atp5c1-201ENSMUST00000026887 1060 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ly6g6d-201ENSMUST00000007259 546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Fbxl15-201ENSMUST00000026256 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Nrn1-203ENSMUST00000223611 1443 ntBASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Gas6-201ENSMUST00000033828 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Klhl33-201ENSMUST00000164415 1602 ntTSL 5 BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Shisa2-201ENSMUST00000053949 3119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.1■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Mid1ip1-201ENSMUST00000008179 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Haglr-201ENSMUST00000100000 2085 ntBASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Abcd4-201ENSMUST00000021666 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Fbxl3-201ENSMUST00000022720 4309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Pid1-201ENSMUST00000168574 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ddn-201ENSMUST00000075444 3740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Cdv3-202ENSMUST00000072249 3787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Nudt22-203ENSMUST00000180765 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 4930461C15Rik-201ENSMUST00000133622 1302 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Fmr1-201ENSMUST00000088546 4409 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Acaa1a-201ENSMUST00000039784 1762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ptgfrn-201ENSMUST00000102694 5902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Plekha4-206ENSMUST00000211155 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Rbpms-203ENSMUST00000053251 2466 ntTSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Zfp326-201ENSMUST00000031227 2667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Mycn-201ENSMUST00000043396 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Katnbl1-201ENSMUST00000028552 2886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Man1c1-202ENSMUST00000054096 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.09■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Mxi1-201ENSMUST00000003870 5156 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Card10-202ENSMUST00000164826 4726 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Tbc1d13-201ENSMUST00000044556 3595 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Ccdc184-201ENSMUST00000031914 2329 ntAPPRIS P1 BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Rsph3a-201ENSMUST00000097423 2189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Syngr1O55100 Cxcl14-202ENSMUST00000224801 1467 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Naa10-205ENSMUST00000114390 797 ntTSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Arl6ip4-202ENSMUST00000122394 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm18666-201ENSMUST00000190039 958 ntBASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Dtwd2-203ENSMUST00000163590 2857 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Pigt-201ENSMUST00000103101 2562 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Zfp446-202ENSMUST00000108535 2594 ntTSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Abhd5-204ENSMUST00000156520 3157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Sft2d2-201ENSMUST00000043338 5535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Nr1h2-204ENSMUST00000107912 1839 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gpr161-202ENSMUST00000178700 1827 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Fbxo7-203ENSMUST00000120344 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 2310002F09Rik-201ENSMUST00000181454 1607 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Rbmxl1-202ENSMUST00000211719 1622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Rfx7-201ENSMUST00000093820 7988 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Hbs1l-203ENSMUST00000092674 2625 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Obsl1-202ENSMUST00000113567 5679 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Scamp3-201ENSMUST00000029684 1489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Aifm1-201ENSMUST00000037349 2237 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Tmc6-202ENSMUST00000103025 1279 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ssu72-202ENSMUST00000105595 874 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ccdc6-203ENSMUST00000147545 5511 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm44878-201ENSMUST00000205812 1295 ntBASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Vps37d-202ENSMUST00000076203 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ube2s-201ENSMUST00000079496 1238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 2610301B20Rik-201ENSMUST00000080517 2116 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Sytl3-201ENSMUST00000097430 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Camta1-204ENSMUST00000105670 4961 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Dtx2-201ENSMUST00000005072 2562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ccdc106-204ENSMUST00000207974 2492 ntTSL 2 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Necab3-202ENSMUST00000109716 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 BC029722-201ENSMUST00000124586 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Matr3-214ENSMUST00000190029 2845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Mfsd4b1-201ENSMUST00000163705 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Opn4-202ENSMUST00000168444 2075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Kmt2b-201ENSMUST00000006470 8469 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Fam131b-203ENSMUST00000143278 4104 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Icmt-201ENSMUST00000048892 4919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm13216-201ENSMUST00000117145 591 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm24841-201ENSMUST00000158676 357 ntBASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Snx16-201ENSMUST00000029047 2288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Csk-201ENSMUST00000034863 2749 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gnb1-202ENSMUST00000105616 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Dph1-201ENSMUST00000044949 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Akap8l-201ENSMUST00000050214 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Evx1-201ENSMUST00000031787 2877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Enah-210ENSMUST00000193074 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Scrib-202ENSMUST00000063747 5440 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Gm45412-201ENSMUST00000210217 2275 ntBASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Fam181a-201ENSMUST00000179363 1406 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Negr1-202ENSMUST00000074015 4983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Ccdc124-201ENSMUST00000007865 1356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 H2-D1-202ENSMUST00000172785 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Grina-201ENSMUST00000023225 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Wdr86-201ENSMUST00000068693 2364 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Syngr1O55100 Mrps10-204ENSMUST00000120737 1017 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.7 ms