Protein–RNA interactions for Protein: O55028

Bckdk, [3-methyl-2-oxobutanoate dehydrogenase [lipoamide]] kinase, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 412 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BckdkO55028 Nespas-203ENSMUST00000151472 2248 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Xpo4-209ENSMUST00000174545 8680 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Zdhhc12-202ENSMUST00000102865 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm12382-201ENSMUST00000122005 922 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm26879-201ENSMUST00000181127 1176 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm7977-201ENSMUST00000193787 748 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Grhpr-201ENSMUST00000045078 1280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm9803-201ENSMUST00000057649 563 ntAPPRIS P1 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm43294-201ENSMUST00000202850 2490 ntBASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Pgm3-202ENSMUST00000072585 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Fam171b-201ENSMUST00000051454 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Misp-205ENSMUST00000219305 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Adgrb2-204ENSMUST00000106015 4982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Tfdp2-209ENSMUST00000188750 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Sirt7-201ENSMUST00000080202 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.97■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Shq1-204ENSMUST00000170667 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm44544-201ENSMUST00000207052 1844 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Trap1-201ENSMUST00000006137 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Zbtb24-201ENSMUST00000080771 2844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Lonrf1-201ENSMUST00000065297 3930 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Usp49-201ENSMUST00000024779 8252 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Phtf1-203ENSMUST00000090685 3006 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Tnks-201ENSMUST00000033929 9163 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Cyr61-201ENSMUST00000029846 2019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Trim67-202ENSMUST00000167588 8735 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Zfp64-202ENSMUST00000109161 1009 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm15723-201ENSMUST00000139331 600 ntTSL 3 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 4930554G22Rik-201ENSMUST00000196102 686 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 AC135963.1-201ENSMUST00000211640 717 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm5417-201ENSMUST00000079706 384 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Coro7-202ENSMUST00000090480 1147 ntTSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Syngr1-202ENSMUST00000009728 819 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Tle3-211ENSMUST00000161689 2836 ntTSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Tspoap1-202ENSMUST00000100644 7390 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Sik3-204ENSMUST00000126865 6287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gne-202ENSMUST00000102936 2920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Taok3-203ENSMUST00000111978 4467 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Gm38345-201ENSMUST00000192635 1748 ntBASIC15.96■□□□□ 0.15
BckdkO55028 Shank3-203ENSMUST00000109309 7365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.96■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Slc35g2-201ENSMUST00000093792 1590 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.96■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Cacna1a-201ENSMUST00000121390 7926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Adam15-203ENSMUST00000107446 1686 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Fkrp-201ENSMUST00000061390 2827 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ankrd63-201ENSMUST00000104937 4861 ntAPPRIS P1 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Scrn2-201ENSMUST00000021249 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Map3k10-202ENSMUST00000108341 3403 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Slc25a39-202ENSMUST00000107098 1606 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Hipk2-206ENSMUST00000161779 7684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Bean1-203ENSMUST00000167633 3275 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm42417-201ENSMUST00000191849 2256 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Prlh-201ENSMUST00000166281 276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Cpne1-217ENSMUST00000184265 871 ntTSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm37292-201ENSMUST00000192062 758 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 AC153845.2-202ENSMUST00000213372 807 ntTSL 3 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Atp23-201ENSMUST00000026504 903 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Nme2-202ENSMUST00000072566 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Irx4-202ENSMUST00000176684 2384 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm2788-202ENSMUST00000147173 1390 ntTSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Slc2a8-201ENSMUST00000028129 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Mcl1-201ENSMUST00000037947 3418 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Zmiz1-201ENSMUST00000007961 5397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Fiz1-208ENSMUST00000208944 2306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Zswim8-201ENSMUST00000022358 6073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm43808-201ENSMUST00000202534 2065 ntBASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Mink1-202ENSMUST00000072873 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.95■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rps6ka1-202ENSMUST00000105894 3135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Frmd5-203ENSMUST00000121219 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Retreg1-201ENSMUST00000022881 3248 ntTSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tubgcp4-203ENSMUST00000110658 4250 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Pdap1-201ENSMUST00000031627 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ust-201ENSMUST00000061601 4228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rab1b-201ENSMUST00000025804 1835 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Abhd10-201ENSMUST00000066983 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Scarf2-201ENSMUST00000012161 3302 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm11643-201ENSMUST00000119578 864 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 2210408F21Rik-213ENSMUST00000153057 652 ntTSL 3 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Prr23a1-201ENSMUST00000170349 883 ntAPPRIS P1 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm29994-201ENSMUST00000195495 1193 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Tomm20-202ENSMUST00000212771 458 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 AC122465.1-201ENSMUST00000220813 1209 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Nme4-201ENSMUST00000025007 912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Lrrc73-201ENSMUST00000095262 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Shroom4-202ENSMUST00000103005 4839 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Lhx6-203ENSMUST00000112963 3481 ntTSL 2 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rnf38-203ENSMUST00000102934 5240 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 St7l-202ENSMUST00000106769 2428 ntTSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Kcnq5-203ENSMUST00000115300 6975 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Gm43338-201ENSMUST00000198617 2223 ntBASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Acadvl-201ENSMUST00000018718 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rundc3a-202ENSMUST00000107102 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Chmp2b-201ENSMUST00000004965 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Rae1-201ENSMUST00000029013 1742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ankdd1a-201ENSMUST00000061766 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.94■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Eif2b5-201ENSMUST00000003320 3186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Cops8-201ENSMUST00000036153 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Meg3-201ENSMUST00000124106 1988 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Lzts2-201ENSMUST00000039016 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Ncoa5-201ENSMUST00000040381 3179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Dcxr-202ENSMUST00000106148 830 ntTSL 2 BASIC15.93■□□□□ 0.14
BckdkO55028 Nsl1-203ENSMUST00000139340 837 ntTSL 1 (best) BASIC15.93■□□□□ 0.14
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 29.4 ms